高通量ChIP-seq測定助力全基因組蛋白質-DNA分析
瀏覽次數:4274 發布日期:2016-4-5
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Porvair Sciences公司
Chromatrap®產品事業部發布一則新的應用筆記,介紹Chromatrap® ChIP-seq測定如何助力全基因組蛋白-DNA調控網絡的研究。
蛋白質-DNA相互作用的全基因組映射在基因調控研究中必不可少。一份表觀遺傳標記和轉錄因子結合的詳細圖譜是推斷調控網絡和鞏固各種生物系統基因表達的關鍵。研究這些相互作用時,ChIP和大規模平行測序(ChIP-seq)是最廣泛的使用工具。
新應用筆記詳述了Chromatrap® ChIP-seq試劑盒與Illumina公司ChIP-seq文庫制備試劑盒和測序平臺一起使用時,如何為測序提供高品質的DNA。由于Chromatrap®獨有的固相基質和可選96孔板測定,所需較小的樣品量、減少的離心沖洗步驟和無需封閉的基質,樣本通量和再現性得以極大提高。
Chromatrap® ChIP-seq 測定可兼容富集片段的直接測序、深度測序,可助力蛋白-DNA調控網絡的全基因組研究,提供公正的研究數據。惰性固體載體基質可重現捕獲和從少量input染色質中獲取的重要調節復合物的全基因組擴增。進一步的結果表明Chromatrap® ChIP-seq可用于了解人子宮內膜雌激素受體的基因組廣泛結合模式;且是大規模并行新一代測序的快速、多重分析工具。