劍橋結構數據庫（CSD）由劍橋晶體數據中心（CCDC）維護，是全球最大的小分子晶體結構數據庫，包含近129萬個結構。CSD不僅是數據存儲的寶庫，更是開發新藥、農用化學品和新型功能材料的重要數據源。
為了更好地利用這一龐大資源，CCDC提供了一系列先進的軟件工具，包括CSD-CrossMiner、GOLD和Mogul。這些工具結合了豐富的CSD晶體數據，幫助科學家們更好地理解分子間的相互作用，支持藥物分子的優化和新藥的開發。

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一、藥效團導向的結構數據庫探索：CSD-CrossMiner在現代藥物發現中的創新應用

時間：7月18日（周四）下午15:00-16:20

藥效團是藥物分子中與生物靶點發生特定相互作用的化學特征，構建藥效團模型是計算藥物設計的一種重要方法。CSD-CrossMiner是一款基于藥效團搜索數據庫的創新工具，能夠在CSD和PDB中高效搜索匹配的結構。通過CSD-CrossMiner，研究人員可以交互式地構建和修改藥效團特征，識別關鍵的分子骨架和相互作用模式，從而加速新藥的發現和優化。

在本次講座中，我們將詳盡介紹CSD-CrossMiner的工作原理和獨特特點，并詳細解釋各種藥效團特征及其在藥物設計中的應用。

此外，我們將通過實際案例展示CSD-CrossMiner在不同研究場景下的多功能性，特別是在骨架躍遷和反向尋靶的應用。通過操作演示，您將直觀體驗該軟件的高級功能，學習如何有效地構建藥效團，優化您的分子設計。

二、揭秘金屬離子與大環分子：通過GOLD軟件進行精準對接

時間：7月25日（周四）下午15:00-16:20 

金屬離子和大環分子在藥物研發項目中非常常見，但其復雜的結構和相互作用模式對分子對接提出了更高的要求。GOLD是CCDC開發的一款專業軟件，為蛋白質-配體對接提供了完整的解決方案。依托于CCDC豐富的晶體數據，GOLD在生成分子對接構象、處理含金屬離子的體系對接以及模擬有水分子參與的配體-蛋白質相互作用等方面展現出顯著優勢。通過使用GOLD軟件，研究人員可以精確模擬分子結合構象，探索分子間的相互作用，從而優化藥物設計。

在本次講座中，我們將詳盡介紹GOLD軟件關鍵功能和參數設置，包括蛋白柔性處理、配體構象生成、水分子處理、金屬處理等方面。

此外，我們將通過具體案例和軟件實操，重點展示GOLD軟件處理復雜對接體系的能力，特別是在金屬蛋白對接、有機金屬化合物或大環化合物與蛋白的對接方面的技術優勢。

三、探索分子結構的奧秘：使用ConQuest和Mogul獲取扭轉角分布知識

時間：8月1日（周四）下午15:00-16:20 

分子的三維結構和構象是決定其生物活性的重要因素。Mogul和ConQuest是由CCDC提供的兩款專門用于小分子構象檢索和分析的強大工具。Mogul能夠迅速評估分子構象在實際晶體環境中的分布情況，而ConQuest則專用于從CSD檢索和提取結構信息，并與Mercury軟件無縫對接，進行參數統計和圖形展示。這些工具為藥物設計提供了重要的晶體學數據支持和構象分析手段。

在本講座中，我們將詳細介紹Mogul軟件的核心功能及其實際應用，尤其是如何利用Mogul進行分子結構的驗證和構象異構體的生成。

同時，我們也將詳細探討如何結合使用ConQuest和Mercury軟件來獲得特定扭轉角度的分布數據，并展示如何應用這些數據在藥物設計中獲得新的靈感。

別錯過這次機會，加入我們的講座，擴充您的科研工具箱，掌握CCDC軟件的高效應用技巧。我們期待與您一起探索CCDC在藥物研發中的無限可能！