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RAP-PT-V2高通量植物分蘗測量系統(tǒng)
高通量植物分蘗測量系統(tǒng)用于測量溫室盆栽的禾本科植物的分蘗數(shù)、分蘗角度、分蘗大小、分蘗形狀等分蘗參數(shù);以及株高、株型、顏色、生物量等植株性狀參數(shù)。以微型CT和RGB成像為基礎(chǔ),結(jié)合農(nóng)業(yè)應(yīng)用實踐重新設(shè)計,主要包括自動傳送系統(tǒng)、X-射線發(fā)射器、X-射線檢測器、自動旋轉(zhuǎn)平臺、伺服電機(jī)控制器和電腦工作站。測量時利用傳送系統(tǒng)將被測植株傳送至旋轉(zhuǎn)平臺,通過電腦工作站對伺服電機(jī)控制器進(jìn)行調(diào)控,使之穩(wěn)定勻速驅(qū)動旋轉(zhuǎn)平臺進(jìn)行360°自動旋轉(zhuǎn),圖像自動獲取、存儲和分析,整個測量過程大約3分鐘完成。
系統(tǒng)配置參數(shù)
Micro-CT成像單元主要技術(shù)參數(shù):
視野面積:25 x 20 cm
最小焦點(diǎn)尺寸:約0.035 mm
實際工作電壓(kV):40
實際工作電流(mA):1
劑量當(dāng)量率:0.06 μSv/h
RGB成像單元主要技術(shù)參數(shù):
視野面積:1607 mm (height) x 1347 mm (width)
分辨率:2452 (height) × 2056 (width)
鏡頭焦距:8 mm
每株水稻拍攝圖像幀數(shù):20
物距:1520 mm
系統(tǒng)結(jié)構(gòu)圖
圖(a)高通量植物分蘗測量系統(tǒng)整體結(jié)構(gòu)圖,圖(b)x-ray單元及RGB單元布局設(shè)計,圖(C)不同角度的水稻樣品,圖(d)不同角度的x-ray投影圖像采集,圖(e)正弦圖獲取,圖(f)重建投影圖,圖(g)圖像分割處理,(h)分蘗數(shù)、分蘗大小、分蘗形形狀提取,(i)分蘗角度計算,圖(j)水稻植株表型和分蘗表型性狀。
系統(tǒng)自動測量結(jié)果與人工測量值相關(guān)性分析,分蘗數(shù)量、分蘗直徑、莖壁厚與人工測量值之間的相關(guān)性達(dá)到0.857、0.959、0.995.
水稻分蘗和拔節(jié)期動態(tài)分析結(jié)果,圖(a-i)是水稻在9個不同的生長點(diǎn)下RGB圖像和CT重建圖像,圖(j-m)總的分蘗面積、拔節(jié)初期樣品數(shù)量、綠色值以及平均分蘗角度與其各自對應(yīng)的一階導(dǎo)數(shù)在9個不同生長點(diǎn)的分析。
在分蘗盛期總分蘗面積的絕對增長率(AGRTTA_5)、分蘗總面積(TTA_5)、分蘗數(shù)量性狀GWAS分析結(jié)果。
在9個不同的時期,平均分蘗角度(MEANTA)的GWAS分析結(jié)果。