PEAKS GlycanFinder--深入分析糖蛋白質(zhì)組學提供高靈敏度和高準確度的獨特解決方案
PEAKS軟件產(chǎn)品家族新成員PEAKS GlycanFinder旨在為用戶提供高靈敏度和高精確度的糖蛋白質(zhì)組學分析整體軟件方案。GlycanFinder既可以給出糖基化位點,也可根據(jù)糖肽碎片提供糖的結(jié)構(gòu)信息注釋,兼容N糖和O糖的分析。支持目前最新的主流儀器,如Orbitrap,timsTOF,ZenoTOF等。
全新的GlycanFinder算法體系
糖蛋白質(zhì)組學的研究需要一種新的數(shù)據(jù)分析方法來充分利用質(zhì)譜數(shù)據(jù)中的碎片信息,從而得到更全面的糖的分析結(jié)果。PEAKS GlycanFinder提供了一個完整的針對大規(guī)模糖蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析的解決方案,利用更為先進的質(zhì)譜技術(shù)(如離子淌度)所提供的數(shù)據(jù)信息,將peptide-based和glyco-based方案相結(jié)合,用于處理復雜度更高的聚糖和糖蛋白的質(zhì)譜譜圖。
N糖和O糖的糖肽分析
GlycanFinder兼容N糖和O糖的糖譜分析,既可以單獨也可以合并分析。
A-score提供精確的糖基化位點信息
GlycanFinder通過A-score在MS/MS水平對糖基化位點進行精確鑒定。A-score通過-10logP計算,P表示糖基化位點隨機匹配的可能性。因此,A-score越大說明這條肽段上匹配到該糖基化位點的可信度越高。
精確糖基化位點與聚糖4D結(jié)構(gòu)表征
糖肽上的糖鏈都會給出一個S-score(%),表示糖庫中匹配到該糖鏈組成的糖型的匹配可信度。對于糖庫中相同組成成分的糖型,候選糖鏈會按照糖的Y-ion數(shù)量排序。S-score得分越高越好,100%意味著只有1個候選結(jié)構(gòu)并且匹配得非常好。0%意味著top1和top2的結(jié)構(gòu)非常相似,無法確切地說哪個是最佳匹配。
糖的從頭測序
GlycanFinder支持對糖庫中沒有匹配到的糖譜進行從頭測序,從而幫助用戶發(fā)現(xiàn)樣本可能存在的新的聚糖成分。
自動報告糖基化位點結(jié)果
GlycanFinder可以精確識別目標蛋白上糖基化修飾發(fā)生的位點,并以餅圖和列表的形式展示同一個位點上不同糖型的豐度分布。在非標記定量方法中,可以比較不同樣本間糖基化的相對變化。
全新的用戶圖形界面
延續(xù)PEAKS系列產(chǎn)品的風格,GlycanFinder的界面設(shè)計也非常便于解讀、可視化和驗證,以幫助研究人員輕松實現(xiàn)分析的總體目標,支持人工進行譜圖查看、檢驗。直觀的匯總統(tǒng)計數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)視圖為用戶提供了深入的數(shù)據(jù)分析及非常有意義的樣本中糖蛋白的深刻理解。
基于位點的糖肽定量
GlycanFinder對非標記和標記實驗都可以完成糖肽之間的定量,并通過直觀的結(jié)果展示頁面對多個樣本間的定量值進行比較,讓您快速查看樣本間的表達變化。
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百蓁生物是一家以AI驅(qū)動質(zhì)譜技術(shù)、聚焦精準醫(yī)療的生物科技公司,其子公司百蓁生物科技(上海)有限公司,在中國全面負責加拿大Bioinformatics Solutions Inc.旗下PEAKS軟件全系列產(chǎn)品商務(wù),銷售和技術(shù)工作,為中國蛋白質(zhì)組學和生物藥領(lǐng)域,提供世界領(lǐng)先的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件和蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域相關(guān)的整體解決方案,包括:PEAKS Studio、PEAKS Online、PEAKS AB、PEAKS GlycanFinder等。
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