按品牌選擇
 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||
| [發表評論] [本類其他產品] [本類其他供應商] [收藏] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 銷售商： 百蓁生物科技（上海）有限公司 | 查看該公司所有產品 >> |
PEAKS® GlycanFinder 結構分辨的糖蛋白組和糖組學深度分析軟件
PEAKS® GlycanFinder是一款具有糖結構分辨的，用于深入分析基于LC-MS/MS數據的糖蛋白質組學和糖組學的綜合性軟件。我們很高興于今天發布PEAKS® GlycanFinder 2.5新版本。
GlycanFinder功能亮點
糖蛋白組的完整糖肽定性與定量
對于糖蛋白質組，PEAKS® GlycanFinder提供兩個工作流來對N糖和O糖基化肽段進行定性和定量分析。Glycan Site Profiling工作流用于分析糖基化位點，結果可匯總展示多酶切質譜數據各自鑒定到的肽段。Glycan Sample Profiling工作流用于糖蛋白、糖肽和非糖肽水平的非標記和標記定量分析。
01深入了解糖的異質性-糖鏈結構和糖基化位點剖析
為了確保糖蛋白組的更深入覆蓋，Glycan Site Profiling工作流提供了位點異質性的詳細視圖，揭示了每個糖基化位點上不同糖型的分布和豐度。通過PEAKS特有的整合多個酶切樣本的質譜數據，全面揭示每個糖基化位點的糖譜，提升可信度。
圖2. 完整蛋白覆蓋視圖和糖型比例分布圖
此外，PEAKS® GlycanFinder使用Charge Lookup策略提升糖肽定量分析的重現性，即使有些Feature存在MS2譜圖缺失，也能確保所有檢測到的糖肽Feature參與計算。
02 糖肽和糖蛋白定量
圖4. Feature view of LFQ
>報告離子定量（RIQ）：基于不同標簽產生的報告離子信號強度實現相對定量，支持商業化試劑iTRAQ/TMT或用戶自定義標簽。
圖5. 報告離子定量的糖肽視圖
New 基于LC-MS/MS的糖組定性與定量
通過PEAKS® GlycanFinder新增的Released Glycan Sample Profiling工作流，用戶可輕松實現糖組學的分析。軟件內置一些常見聚糖的修飾，也支持用戶自定義，并可以進行游離糖的報告離子定量分析。
01 為糖蛋白組研究擴充糖組學數據
PEAKS® GlycanFinder支持糖基修飾和加合離子分析，以及交叉環（crossing ring）注釋，因此使得糖譜注釋和鑒定更加準確。
02 游離糖的報告離子定量
New PRM靶向定量分析
PEAKS GlycanFinder 2.5的PRM 工作流可實現糖肽的靶向定量分析，根據用戶自定義的transition list，提供目標糖肽的定量結果和MS2譜圖注釋。
New Glycan Network-破譯功能性糖基的關聯
圖9.聚糖網絡圖
GlycanFinder特有功能
圖10. 鏡像圖展示排名前二的聚糖候選
若您想深入了解PEAKS® GlycanFinder 2.5的功能和應用，歡迎掃描下方二維碼提交您的咨詢信息！
-掃碼關注-
www.bioinfor.com (EN)
www.deepproteomics.cn（CN）
作為生物信息學的領軍企業，BSI專注于蛋白質組學和生物藥領域，通過機器學習和先進算法提供世界領先的質譜數據分析軟件和蛋白質組學服務解決方案，以推進生物學研究和藥物發現。我們通過基于AI的計算方案，為您提供對蛋白質組學、基因組學和醫學的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數千家學術和工業用戶，包括：PEAKS®️ Studio，PEAKS®️ Online，PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB，DeepImmu®️ 免疫肽組發現服務和抗體綜合表征服務等。
聯系方式：021-60919891；sales-china@bioinfor.com
PEAKS® GlycanFinder是一款具有糖結構分辨的，用于深入分析基于LC-MS/MS數據的糖蛋白質組學和糖組學的綜合性軟件。我們很高興于今天發布PEAKS® GlycanFinder 2.5新版本。
GlycanFinder功能亮點
- 整合糖蛋白組和糖組學的解決方案-完整糖肽和游離糖的定性定量。New!
- 具備結構分辨的N糖譜和O糖譜深度表征-優化的糖組學和糖蛋白組的可信糖結構分析。New！
- 糖基化位點全面剖析-通過多酶聯合酶解實現糖基化位點的全景表征。
- 準確而靈活的發現和靶向定量方法-支持非標記和標記完整糖肽定量，新版本增加PRM靶向定量方法。New！
- 糖的從頭測序-發現新的糖。
- 儀器商中立-支持Orbitrap, timsTOF和zenoTOF數據
- 交互式可視化和報告導出-優化的圖形用戶界面（GUI），方便用戶實現一系列驗證、數據查看和導出結果的需求。
糖蛋白組的完整糖肽定性與定量
對于糖蛋白質組，PEAKS® GlycanFinder提供兩個工作流來對N糖和O糖基化肽段進行定性和定量分析。Glycan Site Profiling工作流用于分析糖基化位點，結果可匯總展示多酶切質譜數據各自鑒定到的肽段。Glycan Sample Profiling工作流用于糖蛋白、糖肽和非糖肽水平的非標記和標記定量分析。
圖1 完整糖肽分析工作流
01深入了解糖的異質性-糖鏈結構和糖基化位點剖析
為了確保糖蛋白組的更深入覆蓋，Glycan Site Profiling工作流提供了位點異質性的詳細視圖，揭示了每個糖基化位點上不同糖型的分布和豐度。通過PEAKS特有的整合多個酶切樣本的質譜數據，全面揭示每個糖基化位點的糖譜，提升可信度。
圖2. 完整蛋白覆蓋視圖和糖型比例分布圖此外，PEAKS® GlycanFinder使用Charge Lookup策略提升糖肽定量分析的重現性，即使有些Feature存在MS2譜圖缺失，也能確保所有檢測到的糖肽Feature參與計算。
圖3. Charge Lookup
02 糖肽和糖蛋白定量
Glycan Sample Profiling工作流可以進行完整糖肽和糖蛋白的可靠鑒定和定量，支持非標記和報告離子定量方法。
>非標記定量（LFQ）：基于不同樣本中肽段特征峰的相對豐度進行定量，并通過Match Between Runs對不同樣本中同一肽段的特征峰進行匹配。
>非標記定量（LFQ）：基于不同樣本中肽段特征峰的相對豐度進行定量，并通過Match Between Runs對不同樣本中同一肽段的特征峰進行匹配。
圖4. Feature view of LFQ>報告離子定量（RIQ）：基于不同標簽產生的報告離子信號強度實現相對定量，支持商業化試劑iTRAQ/TMT或用戶自定義標簽。
圖5. 報告離子定量的糖肽視圖New 基于LC-MS/MS的糖組定性與定量
通過PEAKS® GlycanFinder新增的Released Glycan Sample Profiling工作流，用戶可輕松實現糖組學的分析。軟件內置一些常見聚糖的修飾，也支持用戶自定義，并可以進行游離糖的報告離子定量分析。
01 為糖蛋白組研究擴充糖組學數據
PEAKS® GlycanFinder支持糖基修飾和加合離子分析，以及交叉環（crossing ring）注釋，因此使得糖譜注釋和鑒定更加準確。
圖6. 含Na加合物的游離糖鑒定
圖7.帶有修飾的糖鏈鑒定
02 游離糖的報告離子定量
報告離子定量使得游離糖的定量更加準確，提升了糖定量的靈敏性和重現性，為不同樣本間糖的組成和含量變化研究提供更加可靠的數據支持。
圖7. Released Glycan的RIQ結果
New PRM靶向定量分析
PEAKS GlycanFinder 2.5的PRM 工作流可實現糖肽的靶向定量分析，根據用戶自定義的transition list，提供目標糖肽的定量結果和MS2譜圖注釋。
圖8. 糖肽靶向定量結果
New Glycan Network-破譯功能性糖基的關聯
Glycan Network展示了各種糖型之間的關聯，每條邊連接的兩個糖之間僅有一個糖單元組成不同，因此可將具有共同核心結構的、末端不同的糖全面可視化。以下圖形表明存在兩個糖合成和加工的路徑[1]。
圖9.聚糖網絡圖GlycanFinder特有功能
- 糖基化結構特異性 s-score
圖10. 鏡像圖展示排名前二的聚糖候選- 聚糖從頭測序
當糖肽譜無法與數據庫匹配時，PEAKS® GlycanFinder將執行N-聚糖的從頭測序。這可以幫助用戶找到數據庫中沒有考慮到的其他聚糖結構。
PEAKS® GlycanFinder是一款具有糖結構分辨率的，用于深入分析的糖蛋白質組學和糖組學的綜合性軟件。PEAKS® GlycanFinder 2.5整合了完整糖肽和游離糖的分析方法，從LC-MS/MS數據中分析糖蛋白，并利用深度學習算法解決糖基化位點和聚糖結構的不確定性問題。PEAKS® GlycanFinder將peptide-based和glycan-based兩個策略結合，并整合了聚糖從頭測序技術，有助于加強N-link和O-link的定性和定量分析，從而對糖蛋白質組進行高可信度的全面分析。
PEAKS® GlycanFinder是一款具有糖結構分辨率的，用于深入分析的糖蛋白質組學和糖組學的綜合性軟件。PEAKS® GlycanFinder 2.5整合了完整糖肽和游離糖的分析方法，從LC-MS/MS數據中分析糖蛋白，并利用深度學習算法解決糖基化位點和聚糖結構的不確定性問題。PEAKS® GlycanFinder將peptide-based和glycan-based兩個策略結合，并整合了聚糖從頭測序技術，有助于加強N-link和O-link的定性和定量分析，從而對糖蛋白質組進行高可信度的全面分析。
若您想深入了解PEAKS® GlycanFinder 2.5的功能和應用，歡迎掃描下方二維碼提交您的咨詢信息！
-掃碼關注-
www.bioinfor.com (EN)
www.deepproteomics.cn（CN）
作為生物信息學的領軍企業，BSI專注于蛋白質組學和生物藥領域，通過機器學習和先進算法提供世界領先的質譜數據分析軟件和蛋白質組學服務解決方案，以推進生物學研究和藥物發現。我們通過基于AI的計算方案，為您提供對蛋白質組學、基因組學和醫學的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數千家學術和工業用戶，包括：PEAKS®️ Studio，PEAKS®️ Online，PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB，DeepImmu®️ 免疫肽組發現服務和抗體綜合表征服務等。
聯系方式：021-60919891；sales-china@bioinfor.com
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com