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銷售商： 賽默飛世爾科技（Life Technologies） | 查看該公司所有產品 >> |
Ion S5™系統提供了一套高度簡化的靶向測序流程， 單次測序所需手工操作時間不到15分鐘。 同時也是唯一一款同時兼容靶向測序、 小基因組、 外顯子組和轉錄組測序的臺式測序儀。 基于新一代半導體測序技術和最新的 Ion Hi-Q™化學試劑， Ion S5系統能夠為用戶提供更快運行速度、 簡化的靶向測序流程以及高質量數據。
Ion Torrent半導體測序技術運用大規模并行半導體傳感器專利技術， 直接對DNA復制過程中生成的氫離子進行實時檢測。 Ion Torrent半導體芯片中高密度的微孔陣列提供了數百萬個單獨的反應器， 而集成的流體通路引導反應試劑流經傳感器陣列。這種流體通路、 微型機械加工與半導體技術的獨特組合， 能夠將遺傳信息(DNA)直接轉換為數碼信息(DNA序列)， 為您的研究應用快速生成大量的高質量數據。
Ion S5系統主要性能
• 無需復雜的光路系統， Ion Torrent半導體測序技術利用天然核苷酸反應， 實現高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測靈敏度來探測低頻變異。
• 相比市場上其他基于光學檢測技術的測序平臺， IonS5系統幫助希望引入新一代測序技術的實驗室降低初期投入成本。
• 支持多種不同價格和通量的半導體芯片(Ion 510™、Ion 520™、 Ion 530™和Ion 540™芯片)， 從而為用戶開展各類DNA/RNA測序應用項目提供更大的靈活性。
• 提供最快的新一代測序儀運行速度。
• 依托全球用戶與技術開發者社區-Ion社區(IonCommunity)-這一社區目前已擁有超過3萬名會員，會員人數仍在每天增長中。
• 較小的桌面占用空間， 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸：54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
• 提供廣泛的文庫制備方案與試劑盒選擇， 操作簡單、快速， 起始樣品需求量極低， 適用于微生物測序、靶向基因測序、 外顯子組測序， 以及RNA測序等廣泛研究應用。
• 與Ion Chef™系統或Ion OneTouch™ 2系統配合使用， 實現簡易快速的模板制備。
• 通過整合的T630服務器與Torrent Suite™軟件， 實現從堿基識別到變異解析的完整解決方案。
• 運用Ion Reporter™軟件對配對樣品DNA變異的檢測和分析， 提供簡易和整合的三級數據分析工具。
系統流程、 技術參數與應用
| 性能 | 描述 |
| 最簡捷的靶向測序流程 | "簡單、 快速的自動化工作流程： 靶向測序應用中， 從DNA樣品輸入到獲 得分析數據*的完整過程中手工操作不到45分鐘" |
| • 文庫制備： – Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒： 15分鐘(手工操作時間) – 使用AB Library Builder實驗方案實現自動化文庫制備(13份樣品)： 10分鐘(手工操作時間) – Ion AmpliSeq靶向富集和建庫技術： • 手動建庫方案： 60分鐘(手工操作時間) • Ion Chef系統自動化建庫方案： 15分鐘(手工操作時間) • 模板制備： – Ion OneTouch 2系統： 模板擴增， 手工操作時間2.5小時 – Ion Chef系統： 模板擴增與芯片上樣， 手工操作時間15分鐘 • 測序： – 手工操作時間少于15分鐘 • 數據分析： – 從5百萬讀值數據(200 bp測序反應)獲得比對好的BAM文件， 操作時間不到5小時" | |
| 最快速的新一代測序 | 從DNA樣品到獲得變異結果最快僅需兩個工作日(8小時計算) |
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• 測序反應僅需2.5-4小時即可完成
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| 高度靈活的通量 | 四款芯片分別提供從2百萬至8千萬的序列通量， 用戶可以根據需求靈活選擇 |
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| 每周樣品通量高 | 每周可完成更多數量樣品的完整靶向測序工作流程 |
| • 模塊化工作流程設計， 支持用戶每周(5個工作日)進行多次測序*： 每臺Ion S5系統每周可完成多達10次測序(200堿基讀值) • 模塊化工作流程， 研究人員能夠在一臺Ion S5系統上最多可同時操作384份標記樣品， 每周最多可檢測3840份獨立DNA樣品 * 工作日以8小時計算。 | |
| 簡捷、 直觀的系統 | 盒裝試劑與友好的用戶界面， 為用戶提供一個簡捷的測序流程 |
| • 在Ion Chef系統、 Ion OneTouch 2系統和Ion S5系統上， 用戶可使用直觀的觸摸界面進行編程和操控 • 用戶可通過固定或移動設備(如iOS和Android設備)遠程監控Ion S5測序儀 • 行業標準數據格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF)， 兼容第三方生物信息學軟件提供的下游分析和可視化工具。 • 模塊化工作流程， 可在文庫制備到測序的每一個環節中實施質量控制， 幫助用戶節約時間， 降低試劑成本。 • 通過盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優化流程， 提高效率 | |
| 長堿基讀長 | • 200-、 400-與600-堿基讀長 • 兼容長mate-pair讀長 |
| 最先進硬件 | 牢固而簡潔的硬件值得您信賴 |
| • 設計簡單， 無冗余的活動零件或復雜的附屬系統， 穩健可靠 • 標準臺式系統(Ion S5系統與Ion Chef系統或Ion OneTouch 2系統)， 提供完整擴增與測序工作流程 • 用戶可通過Ion S5系統的外置條碼閱讀器追溯芯片和樣品， 通過Ion S5 Torrent服務器實現樣品登記 • Ion Chef系統與Ion S5系統采用了先進的識別系統， 對編碼耗材進行識別和追蹤， 并將信息集成至Torrent Suite軟件和/或LIMS系統 • 所有Ion S5系統均由符合ISO 13485標準的工廠生產 | |
| 緊湊型臺式系統 | Ion S5 XL系統僅占用很小的桌面空間 |
| • 尺寸(W x D x L) (近似值)： 21.4 x 31.75 x 20 in. (54.2 x 80.6 x 50.9 cm) • 占用面積： 4.72 平方英尺 • 重量(近似值)： 140 lb/63.5 kg | |
| 提供完整產品組合 | 高性價比的新一代測序平臺， 廣泛適用于各類DNA與RNA研究應用 |
| 最低序列偏性 | 高度均一的覆蓋度及精確的變異檢測 |
| • Ion 510/520/530 Kit-Chef與Ion 520/530 Kit-OT2能夠對200和400堿基文庫進行精確、 可靠的測序 • Ion 540 Kit-Chef與Ion 540 Kit-OT2能夠對200堿基文庫進行精確、 可靠的測序 • Ion 520/530 ExT Kit-Chef能夠對600堿基文庫進行精確、 可靠的測序 • 通過簡單的天然化學反應過程獲得均一的覆蓋度(即無偏性) • 基于天然核苷酸， 聚合酶或核苷酸上無附著的熒光基團， 從而實現長堿基讀長和堿基識別的高保真度 |
半導體測序
| 性能 | 描述 |
| 無復雜光路系統 | Ion Torrent半導體測序技術無需光路系統 |
| • 無熒光， 無攝像頭、 無激光、 無LED、 無光學元件 | |
| 由聚合酶介導的簡單化學反應 |
Ion Torrent半導體測序技術基于天然核苷酸反應， 以及無需緩沖液即可與核苷酸結合的高效DNA聚合酶 |
| • 測序在獨立的半導體芯片中開展 • 在無緩沖液反應環境中， DNA聚合酶呈現出色的持續性與保真度 • 通過獲得專利的液流排序算法使核苷酸連續流過半導體芯片， 該算法還具有相位錯誤糾正能力 • 下一組核苷酸反應之前， 上一步反應中任何未結合的殘留核苷酸被充分洗滌去除 • 核苷酸結合之后， 質子從3'端的羥基解離 • 對質子濃度進行精確檢測， 該濃度與每一輪獨立的液流反應循環中參入核苷酸數量成正比 | |
| 高質量數據 | 基于簡單化學反應過程， 無需光路系統， 可獲得高質量數據 |
| • 更長的堿基讀長并具有高保真度的堿基識別能力 • 均一的覆蓋度和高檢測靈敏度， 更好地探測低頻變異 |
文庫制備
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性能 |
描述 |
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簡單快速的基因組DNA 文庫制備 |
Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒為用戶提供了用于基因組和擴增子文庫制備的快速而高度均一的酶切片段化方法 |
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• 單人即可在約2小時內完成插入片段100-至400-堿基的基因組DNA文庫的制備 • 酶切片段化無需物理剪切， 并兼容自動化操作系統(Library Builder系統和自動化系統) • 僅需100 ng DNA樣品即可生成無需擴增的測序文庫 • Ion Torrent芯片上可對多達96個標簽樣品進行混合處理， 這種高度多重化的擴增子測序操作，可以實現單個樣品中數以千計的基因靶標的檢測 |
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簡單、 快速、 靈活的 靶向測序 |
Ion AmpliSeq靶向篩選技術適用于對DNA與RNA靶標進行低起始樣品量、高度多重化、 支持混合樣品的靈活測序需求 |
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• 結合多重PCR技術， 僅需10 ng FFPE DNA或RNA起始樣品量 • 利用 AmpliSeq Designer工具， 對任何基因組都能簡單快速地開展定制設計 • 通過自動化引物設計實現簡單快速的靶向篩選， 僅需數分鐘 • 對要求快速處理的樣本， 僅在兩個8小時工作日內即可完成從基因組DNA樣品輸入到變異檢測結果的整個工作流程， 大幅提升實驗室效率 • 憑借單管12到6144重擴增子與96個標簽序列技術， 實現一次操作處理96份樣品 • 簡單的PCR工作流程， 無需額外設備 • 靈活兼容定制試劑盒與便捷的即用型試劑盒， • Ion Library Equalizer試劑盒無需稀釋、 定量或任何附加設備即可實現對Ion Torrent DNA文庫的均一化處理 • 針對超過20000條基因進行基因表達檢測 |
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構建mate-pair文庫并 開展相關測序 |
Ion TrueMate Plus文庫試劑盒與高效DNA片段鳥槍測序聯合使用， 為用戶提供簡單、 快速、 精確的基因組組裝方法 |
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• Ion TrueMate技術適用于高效的mate-pair片段構建操作， 同時實現最小的序列偏性和極低的冗余度 • 僅需2–10 μg DNA起始樣品量 |
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針對混合微生物群落開 展快速、 全面和廣泛的 研究分析 |
無需培養即可快速鑒定多細菌研究樣品 |
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• 可直接使用樣品中的原始材料， 無需培養、 混合培養或純培養操作 • 針對多個微生物變異區設計的引物組， 幫助用戶在種屬水平對各類細菌進行精確的鑒定 • 兼具靈活性， 引物組分成2管， 單管也可開展獨立分析 • 可使用標簽序列對引物進行標記 |
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快速、 簡單的基因表達 分析 |
Ion AmpliSeq轉錄組人類基因表達檢測試劑盒可檢測超過20000條RefSeq收錄的轉錄本， 兼容FFPE樣品的快速工作流程僅需低至10 ng RNA起始量 |
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• 約1小時手動操作完成文庫制備， 在兩天內即可完成從RNA樣品到獲得基因表達水平信息的完整流程 • 實現低成本的轉錄組測序， 而無需等待數周以收集樣品 • 利用現有的下游微陣列或新一代測序分析技術， 實現簡易， 自動化的基因差異表達數據分析 |
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快速、 靈活的小RNA 與全轉錄組測序 |
Ion總RNA測序v2試劑盒為用戶提供了制備cDNA文庫的快速方法， 適用于全轉錄組或小RNA文庫的鏈特異性測序。 |
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• 小RNA或全轉錄組測序所需的文庫制備通常可在4-6小時之內完成 • 以低至100 ng的poly(A) RNA構建文庫， 或以200 ng去除rRNA的總RNA樣品構建全轉錄組文庫，或以1-100 ng小RNA富集產物構建小RNA文庫 • 保存鏈相關信息， 以便在相對于染色體鏈的轉錄方向上進行數據的比對 • 自動化操作， 兼容基于微球的純化操作 • 通過Invitrogen Ambion RiboMinus真核生物v2試劑盒實現高效的rRNA清除 |
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高質量外顯子組測序 |
Ion AmpliSeq外顯子組RDY試劑盒采用了簡單的PCR富集技術、 檢測通量靈活， 包含完整的生物信息學分析 |
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• 通過簡單、 快速的特異性PCR技術， 不到60分鐘手工操作完成全外顯子組富集 • 最低單外顯子組檢測成本， 可一次檢測1-2個外顯子組， 或每周40小時的工作時間內檢測10個外顯子組， 極具靈活性 • 整合的軟件與分析流程提供關于已注釋變異的集中列表 • 高效富集， 靶向數據和覆蓋均一度均超過90%， 大部分測序深度達到10x和20x • 僅需50 ng DNA和2天時間， 即可完成從DNA樣品到獲得注釋變異的完整流程 |
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適用于所有應用的靈 活、 便捷的樣品標記 |
樣品序列標簽試劑盒與軟件提升測序的樣品通量 |
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• Ion Xpress序列標簽接頭1-96 試劑盒適用于同步分析多重樣品 • Ion Xpress RNA-Seq 序列標簽1-16 試劑盒可同步分析多重RNA樣品 • Torrent Suite軟件可同步處理多達384序列標簽 |
模版制備
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性能 |
描述 |
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無人值守的全自動化模 板擴增和芯片加載 |
Ion Chef系統可自動完成文庫在Ion Sphere微粒上的模板制備， 并自動將模板加載到Ion S5芯片 |
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• 高度自動化， 最低程度人工干預， 僅需15分鐘手工操作 • 單次運行可同時處理兩塊Ion S5芯片， 完成從文庫到半導體芯片加載 • 每人每天可完成4份乃至更多文庫(每份文庫最多384樣品序列標記)的模板制備工作 • 適合各種操作水平的高通量實驗室或用戶 |
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Ion OneTouch 2系統可自動完成文庫在Ion Sphere微粒上的模板制備， 并通過模塊化設計實現樣品的高通量處理 |
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• 整合各種操作水平的高通量實驗室或用戶 • 可與Ion OneTouch 2模板試劑盒配合使用， 在Ion Sphere微粒上穩定生成單克隆擴增模板， 并加載到Ion S5芯片 • 單人每天可完成4份乃至更多文庫(每份文庫最多384樣品序列標記)的模板制備工作 • 可添加Ion OneTouch 2系統， 進一步提高Ion S5系統的樣品處理通量 • 針對低通量實驗室， 這是具性價比的自動化模板制備選項 |
數據分析
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性能 |
描述 |
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單日完成測序與數據分析 |
Ion S5測序儀與Ion S5 Torrent服務器(預裝Torrent Suite軟件)組合， 為研 究人員提供了從堿基識別到變異檢測的完整解決方案 |
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• Ion S5 Torrent服務器與Torrent Suite軟件能夠將儀器數據快速轉換為堿基識別比對結果， 并提供行業標準格式的數據輸出 • Ion RNA-Seq分析插件： 分析全轉錄組RNA測序的輸出結果。 本插件能夠生成讀值比對指標、質控(QC)指標、 基因與轉錄本計數、 樣品校正熱圖與散點圖， 以及基因與轉錄本水平的熱圖 • Ion AmpliSeq RNA插件： 為針對Ion AmpliSeq轉錄組試劑盒的測序輸出結果進行分析而設計。本插件能夠生成讀值比對指標、 質控指標、 讀值分布散點圖、 樣品校正熱度散點圖、 兼容Excel軟件的報告以及差異表達列表 • Torrent變異識別插件： 識別純合或雜合的SNP， 以直觀的插件報告顯示結果，并能夠識別頻率低至5%的單堿基變異 • 自動鑒定擴增子重測序結果中的突變， 并通過廣泛使用的基因組瀏覽器(Integrative GenomicsViewer， 可從broadinstitute.org/igv/home獲取)實現可視化 • 支持樣品序列標記(固定與定制標簽) – 每個標簽都可實現FASTQ分析和質量檢測 – 多達384個定制序列標簽 |
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簡易整合的三級分析工具 |
超越Ion S5 Torrent服務器的直觀數據分析工具 |
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• 用于注釋基因組變異的Ion Reporter軟件 • 用戶可在Torrent瀏覽器插件商店(Torrent Browser Plugin Store)下載其他Torrent Suite軟件插件，適用于基因組測序分析、 靶向測序分析、 變異分析與注釋、 微生物測序分析、 轉接第三方生物信息學軟件包等 • 支持用戶/開發者創建自己的專屬分析插件 • 提供第三方商業化分析工具， 適用于廣泛的Ion Torrent半導體測序應用 • 通過選用四百五十萬多個即用型Applied Biosystems TaqMan探針或設計定制化TaqMan探針， 對Ion Torrent半導體測序所發現的變異進行確認； TaqMan探針能夠為SNP基因型鑒定工作提供出色的靈敏度和特異性確認， 如需提高靈敏度以檢測低頻突變或體細胞突變時， 可通過標準或數字化PCR儀開展分析 |
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