基因組學，是研究生物基因組和如何利用基因的一門學問。該學科提供基因組信息以及相關數據系統利用，試圖解決生物、醫學、工業領域、食品與農業等領域的重大問題。
全基因組表達譜是指全基因組的轉錄水平。通過全基因組表達譜研究，加以生物信息學分析，能夠解析出在特定條件下（疾病、藥物刺激等）整個基因組哪些基因的表達水平上調或下調。生命體是一個復雜的系統，生命活動的調控往往不是單一基因完成的，需要站在宏觀（全基因組）層面上研究基因互作。
全基因組表達譜芯片能夠快速、高通量、特異性地完成全基因組表達譜研究，是全基因組表達譜研究的首選技術手段。
一、技術路線和方法：
二、生物信息學分析
2.1 基本數據分析
Part01：原始數據預處理與均一化
Part02：差異基因篩選
Part03：聚類分析（層次聚類、K-means聚類）
Part04：差異基因GO分類
Part05：差異基因pathway分析
Part06：基因互作網絡構建（Network）
2.2 高級數據分析
Part08：轉錄因子結合位點分析（對植物）
Part09：數據驅動網絡構建（對多個時間點）
Part10：疾病分型
Part11：疾病預測模型構建
Part12：基因表達趨勢顯著性分析
三、芯片平臺
芯片平臺
（Human） |
型號 |
轉錄本數量 |
規格 |
貨號 |
| Affymetrix |
Human Genome U133
Plus 2.0 Array |
47000條(包含38500個基因) |
1× |
BT1000111 |
| Agilent |
SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K |
27958條mRNA |
8×60K |
BT1000112 |
| 7419條lincRNA |
| Agilent |
Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray |
41,000條 |
4×44K |
BT1000113 |
| 華聯 |
人類表達譜芯片v6 |
32679條(包含938條控制探針) |
1× |
BT1000114 |
芯片平臺
（RAT） |
型號 |
轉錄本數量 |
規格 |
貨號 |
| Affymetrix |
Rat Genome 230 2.0 Array |
31000條(包含28000個基因) |
1× |
BT1000131 |
| Agilent |
Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K |
30003條 |
8×60K |
BT1000132 |
| Agilent |
Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray |
41012條 |
4×44K |
BT1000133 |
| 華聯 |
大鼠表達譜芯片v1 |
25338條(包含980條控制探針) |
1× |
BT1000134 |
芯片平臺
（Mouse） |
型號 |
轉錄本數量 |
規格 |
貨號 |
| Affymetrix |
Mouse Genome 430 2.0 Array |
39000條(包含34000個基因) |
1× |
BT1000121 |
| Agilent |
SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K |
39430條mRNA |
8×60K |
BT1000122 |
| 16251條lincRNA |
| Agilent |
Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray |
41174條 |
4×44K |
BT1000123 |
| 華聯 |
小鼠表達譜芯片v2 |
27295條(包含872條控制探針) |
1× |
BT1000124 |
注：其他種類芯片請聯系公司銷售工程師
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