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iTRAQ蛋白質組學服務
同位素標記相對和絕對定量(iTRAQ)技術是一種新的、功能強大的可同時對四種樣品進行絕對和相對定量研究的方法。
服務類別:測序/合成總訪問:7160
最后更新:2022-3-24半年訪問:39
參考報價:詳詢021-60649912
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同位素相對標記和絕對定量(iTRAQ)技術是一種新的、功能強大的可同時對四種樣品進行絕對和相對定量研究的方法。作為一種新的蛋白質絕對和相對定量技術,具有很好的精確性和重復性,并且彌補了DIGE及ICAT的不足。它可以結合非凝膠串聯質譜技術,對復雜樣本、細胞器、細胞裂解液等樣本進行相對定量研究。

技術路線及方法:

該服務方案是從蛋白的提取到結果分析一整套全面解決方案,客戶只需要提供足夠的樣本就可以及時獲得科學結果。我們也可以針對客戶的實際情況量身定做方案,客戶也可以選取其中幾項服務。我們將竭誠為客戶解決問題。

首先您跟我們溝通您的實驗目的與實驗設計,或者讓我們專業的技術人員根據您的實驗目的幫助您設計實驗。然后提供樣品(可以是組織,細胞或血液),我們為您完成所有的實驗操作,并提供完整的實驗報告和數據分析報告。特別的,在項目結束后6個月的時間內我們提供一次免費報告修回和7×24h的問題答疑服務。根據您的需要,我們為您推薦最合適的實驗方案。 

蛋白質組學平臺:

蛋白質組學平臺 型號 廠商 貨號
iTRAQ Nano Aquity UPLC system+Q Exactive Mass spectrometer Waters +Thermo BT3000211
iTRAQ Triple TOF™5600 AB SCIEX BT3000212


 
 
 

 

 

AB Sciex Triple TOF™5600技術特點:

1、同時具有三重四極桿的定量與TOF的精確質量、結構剖析能力;在定性時在速度和靈敏度之間取得平衡,在準確定量時在重現性和精密度之間取得平衡。
2、加速飛行時間分析器(Accelerator TOFTMAnalyzer)--在高速度和工業級的靈敏度下具有高分辨能力。
3、簡潔質量校正EasyMASSTM Accuracy:不需要連續的重現校正,可在LC/MS條件下連續工作50個小時,并達到<2 ppm(約1ppm)RMS的質量準確度。
4、智能高速SmartSpeedTM采集:在高速液相條件下可獲得高分辨率,在1秒內可采集最多100張譜圖,或在1秒內采集50張譜圖并同時進行IDA采集(智能實時數據過濾)。
5、靈敏的高分辨率系統:在高分辨系統中最低的定量(LOQ),定量性能相當于高端三重四極桿。

AB Sciex Triple TOF™5600系統

Q Exactive高性能臺式四極桿—軌道阱LC-MS/MS系統
具有如下意義非凡的創新設計,大大擴展Thermo Scientific Exactive家族Orbitrap系統的功能: 

1、新型離子源光學系統將靈敏度提高達五倍。

2、集成式四極桿質量過濾器實現前體離子選擇性。在Orbitrap HR/AM檢測之前,MS/MS碎裂過程發生在能量更高的碰撞誘導解離(HCD)池中。 

3、先進的信號處理技術能夠在全掃描模式和最大掃描速度下將系統分辨率提高至140,000 FWHM。 

4、新型C-Trap離子光學系統和HCD碰撞池提供了快速HCD MS/MS掃描并改善了低質量數離子的傳遞,從而提高靈敏度和定量性能,尤其適用于使用同位素標簽的實驗。 

5、多重檢測提高了整體系統工作周期的效率,能夠更好的與UHPLC兼容,并在Orbitrap進行同時檢測之前收集并保存多達10種母離子。


Thermo Scientific™ Q Exactive mass spectrometer

樣品要求:
1.體液
血清樣品量要求:500µl/例,一定避免反復凍融;
血液樣品量要求:5ml以上;
尿液樣品量要求:50ml以上;
其他體液(唾液,羊水,腦脊液等):5ml以上,保證不能溶血。
2.組織
動物組織樣品量要求:濕重不少于100mg;
植物組織和菌體樣品量要求:濕重不少于2g。
3.細胞
樣品量要求:5*106
4. 蛋白
樣品量要求:濃度不低于1mg/ml,蛋白量不少于500ug。
 
注意:如果送樣為溶液, 則溶液中一般不要有SDS、CHAPS、Triton X-100、NP40及吐溫 20、40等系列的去污劑。鹽濃度小于50mM。
 
其他種類的樣品在收集之前請聯系公司銷售工程師。

數據分析內容:
2.1 基本數據分析
Part01:數據預處理
Part02:差異蛋白篩選
Part03:層次聚類分析
Part04:PCA分析
Part05:差異蛋白GO分類
Part06:差異蛋白pathway分析
Part07:差異蛋白互作網絡構建
 
2.2 高級數據分析
Part8:多組學數據關聯分析(具備多組學數據)

 

 

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