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全外顯子組測序
指利用Agilent高效捕獲探針雜交富集外顯子區(qū)域的DNA序列,再進行高通量測序,能夠經(jīng)濟、高效地對編碼區(qū)的突變進行檢測。
服務(wù)類別:測序/合成總訪問:1021
最后更新:2025-2-13半年訪問:34
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       外顯子捕獲測序利用捕獲技術(shù)將全基因組范圍內(nèi)的外顯子區(qū)域DNA捕獲富集后進行高通量測序。外顯子捕獲測序主要用來分析外顯子基因組上的變異位點,包含SNP和InDel。
       外顯子區(qū)域占人類基因組1%的比例,但是卻包含了85%左右的疾病變異。相對于全基因組測序,外顯子測序有成本低、高效的優(yōu)點。外顯子測序主要用于識別和研究與疾病、種群進化相關(guān)的編碼區(qū)以及UTR區(qū)域內(nèi)的變異。結(jié)合大量的公共數(shù)據(jù)庫外顯子數(shù)據(jù),有利于更好的解釋所得變異與疾病的關(guān)聯(lián)。外顯子區(qū)域占全基因組比例小,因此更容易做到更深度測序,檢測到更多的低頻和罕見變異。這個特性決定了外顯子測序在遺傳性疾病和腫瘤研究領(lǐng)域的重要地位,尤其是腫瘤異質(zhì)性研究。由于腫瘤異質(zhì)性的特點,腫瘤內(nèi)部有很多的亞克隆,有些亞克隆占比較低,應(yīng)用外顯子測序深度的優(yōu)勢,可以更快更經(jīng)濟的檢測出普通測序深度難以發(fā)現(xiàn)的體細胞突變。

實驗流程

       基因組DNA 采用Agilent SureSelect Human ALL Exon V6 并根據(jù)標準操作流程構(gòu)建外顯子測序文庫,使用Agilent Bioanalyzer High Sensitivity DNA Kit 和Thermo Fisher Scientific Qubit dsDNA High Sensitivity Quantitation Assay對文庫進行定量和片段分布質(zhì)檢。根據(jù)文庫雙端標簽的序列對其進行適當組合, 選擇illumina NovaSeq平臺對文庫進行測序。過程如下圖所示:



數(shù)據(jù)結(jié)果展示:


 
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