病毒是目前發現的最小病原體，由于能夠誘發細胞癌變，因此屬于三種致癌因子之一。病毒誘發人體細胞癌變的主要機制是將自身基因組整合進入人的基因組中引發人基因組的變異。同一種病毒的不同亞型的感染，病毒基因組的突變，以及病毒基因組在人類基因組上整合位置的不同都會對患者的病理進程、治療效果以及預后產生影響。因此，對于致癌病毒的基因組研究應涵蓋亞型識別以及整合位點檢測兩個方面。然而，傳統PCR方法遠遠不能滿足科研工作者的需求，iGeneTech®基于自主研發的液相探針雜交捕獲技術具有通量大、靈敏度高等特點，RNA探針可一次性分析HPV/HBV在DNA水平上的整合位點及游離病毒的鑒定分型，對于闡明與病毒相關的腫瘤發生機制具有很重要的科學意義。
|
類型 |
檢測亞型 |
使用人群 |
|
AI-HPV-Cap |
201種亞型 |
1. HPV感染的女性 2. 有過性行為的女性 3. 免疫功能低下、衛生條件差、性保健意識缺乏的女性 |
|
AI-HBV-Cap |
A、B、C、D、E、F、G、H 8種基因型（共5500條HBV型別） |
肝癌以及受HBV侵染的癌癥患者 |
技術路線
|
樣本要求 |
DNA≥500 ng（濃度≥5 ng/μL） |
|
捕獲平臺 |
AI-HBV-Cap、AI-HPV-Cap |
|
測序策略 |
Illumina PE150 |
|
服務周期 |
15個自然日 |
發表雜志：Oncotarget IF：2.656 發表年份：2016
將人乳頭瘤病毒（HPV）DNA整合到宿主基因組中可以誘使宮頸癌相關的驅動基因突變。單堿基分辨率鑒定HPV整合是一項長期的技術挑戰，主要是由于HPV在表面體或連接體中的敏感性掩蔽。本研究的目的是使用新策略增強對HPV整合位點精確定位的理解。為此，作者使用HPV捕獲技術結合二代測序，研究了47例原發性宮頸癌標本和2例細胞系中HPV的流行情況及HPV基因組在宿主DNA的確切整合位點。共鑒定出117個獨特的HPV整合位點，根據HPV亞型劃分為：HPV16（n=101），HPV18（n=7）和HPV58（n=9）。觀察到HPV16整合位點廣泛地分布整個病毒基因組中。此外，HPV16可能經常發生單個或多個整合事件。除22號染色體外，病毒整合位點分布在幾乎所人基因組上。所有攜帶超過四個HPV16整合位點的宮頸癌病例顯示出臨床診斷為III期癌。并且觀察到在整合斷裂點處人類基因組和HPV基因組之間共享的重疊核苷酸的顯著富集，表明它可能在HPV整合過程中起重要作用。
圖1 47例宮頸癌病例中HPV亞型的分布
圖2 25個病例中117個HPV整合位點的染色體定位
參考文獻
Liu Y, Lu Z, Xu R, et al. Comprehensive mapping of the human papillomavirus (HPV) DNA integration sites in cervical carcinomas by HPV capture technology[J]. Oncotarget, 2016, 7(5):5852-5864.
