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將探針與基因組DNA序列進行雜交，捕獲并富集目標基因組DNA，結合重亞硫酸鹽轉化處理，利用高通量測序技術進行測序的檢測方法
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目標區域甲基化捕獲測序是針對客戶感興趣的基因組區域設計定制探針，將探針與基因組DNA序列進行雜交，捕獲并富集目標基因組DNA，結合重亞硫酸鹽轉化處理，利用高通量測序技術進行測序的檢測方法。iGeneTech®依托于自身捕獲技術開發了兩套目標區域甲基化捕獲技術MethCap®和BisCap®，將目標區域捕獲與甲基化檢測技術完美結合起來。該技術使得對全基因組內感興趣的目標區域進行高通量、高精度的甲基化檢測成為現實，在甲基化組學研究方面提供了一個全方位、穩定、高效、高性價比的技術方法，以滿足不同用戶的研究需求。
產品優勢
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◇ 高精準性：單堿基分辨率，對感興趣的基因組區域及相關基因進行研究，并實現目標區域甲基化位點全覆蓋。 |
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◇ 方便靈活：針對不同的研究目的，兩套技術方案靈活選擇：低起始量（BisCap）和高起始量（MethCap）。 |
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◇ 應用廣：一個panel兩種應用，同時實現突變檢測與甲基化檢測（MethCap）。 |
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◇ 起始量低：適用于低起始量樣本，如cfDNA樣本（BisCap）。 |
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◇ 靈活定制：任意區域的個性化定制。 |
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◇ 高性價比：直接對目標區域進行甲基化捕獲，極大降低成本。 |
技術路線
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樣本要求 |
MethCap：DNA≥3 μg（濃度≥25 ng/μL）；BisCap：gDNA≥500 ng（濃度≥5 ng/μL），cfDNA≥20 ng（濃度≥0.5 ng/μL） |
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捕獲技術 |
MethCap®；BisCap® |
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測序策略 |
Illumina PE150，數據量根據檢測項目決定 |
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服務周期 |
30個自然日 |
文獻案例
發表雜志：Nature Reviews Clinical Oncology IF：24.653 發表年份：2018
癌癥中的DNA甲基化已被作為診斷、預后以及預測用生物標志物的重要靶標。盡管很多科學研究描述了基于DNA甲基化的生物標記及其在癌癥中的臨床關聯，但這些生物標記中僅有14種被批準獲得臨床試驗。本文中，作者回顧了研究DNA甲基化位點對癌癥生物標志物開發的重要性，并詳細介紹各種生物標志物的基因組位置和其他相關特征。
①定位的重要性：傳統上，DNA甲基化研究和基于DNA甲基化的生物標志物研究主要集中于啟動子CpG島的高甲基化對腫瘤抑制基因的影響。然而，即使在單個啟動子區域中，并非所有的CpG島在功能上是等效的。
②診斷甲基化標志物：肝細胞癌（HCC）中，GSTP1 的甲基化被認為是一種有前途的診斷標志物，但其特異性水平差異很大（這種特異性是由同一啟動子的不同特定部分分析得出的）。
③甲基化生物標志物預后：以 GREM1、NMDAR2B、ZAP70 基因為例，說明了該基因甲基化的位置不一樣，癌癥患者的預后也會不同。
④預測甲基化標志物：通過對膠質母細胞瘤患者的MGMT 基因進行甲基化特異性 PCR（MSP）評估，進一步了解了甲基化的特定的模式，鑒定了CpG島的二核苷酸在轉錄調控中的重要作用。
圖1 DNA甲基化生物標志物GSTP1的基因組位
圖2 癌癥生物標志物臨床實施的成功率
參考文獻
Koch A, Joosten S C, Feng Z, et al. Analysis of DNA methylation in cancer: location revisited[J]. Nature Reviews Clinical Oncology, 2018: 1.
