動植物全基因組重測序主要是根據高通量測序技術對生物體不同個體或群體的基因組進行測序，并與已知的參考基因組比對進行差異分析，獲得大量遺傳變異信息，應用于種群遺傳多態性分析、進化分析、功能基因挖掘、育種等研究領域。
產品優勢
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◇ 檢測區域大：全面獲得基因組的變異信息。 ◇ 精準度高：二代測序保證了更準確的測序結果。 |
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◇ 效率更高：基于二代測序技術平臺，更高速、高效。 ◇ 檢測范圍廣：可一次性獲得SNV、InDel、SV、CNV等變異信息。 |
技術路線
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樣本要求 |
DNA≥3 μg（濃度≥25 ng/μL） |
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測序策略 |
Illumina PE150，數據量根據檢測項目決定 |
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服務周期 |
14個自然日 |
發表雜志：Nature Communications IF：12.4 發表年份：2018
法國的汗蜂有兩種生活模式，一種是生活在較冷地區的汗蜂，雌蜂沒有助手；另一種是生活在較暖地區的汗蜂，雌蜂有一個助手。為了研究這種行為模式的差異，作者首先從頭組裝了一只雌蜂的基因組，然后對150個個體進行全基因組重測序。通過關聯分析，發現8個區域的194個SNP存在基因組水平上的顯著差異。其中，最顯著差異的7個SNP富集在ASD相關的基因Syx1a上。該基因已經被證明和突觸融合蛋白有關，并且在其他物種中已經發現和社會性行為密切相關。從而證明該基因是汗蜂的社會性行為的重要遺傳因素。
圖1 社會行為及其基因組位置相關的SNP
圖2 syx1a 位點調控SNPs的功能效應
參考文獻
Kocher S D, Mallarino R, Rubin B E R, et al. The genetic basis of a social polymorphism in halictid bees[J]. Nature communications, 2018, 9(1): 4338.
