微生物和人類的生活息息相關。在和疾病相關的微生物中，抗生素耐藥性、致病菌快速進化、毒力基因多態性，都對相關疾病的預防、治療提出了新的挑戰�；谝合嗵结橂s交的基因捕獲技術，能夠為專注于微生物基因組的某些特定區域，減少研究成本、降低來自宿主基因組或環境中的噪聲，在同等數據量下大大增加測序深度，幫助臨床和科研工作者們更為快速、準確、低價的獲得目標微生物或微生物基因組上特定區段信息，為流行病原檢測、特定耐藥基因、抗性及毒力基因等的篩查，難分離和提取病原微生物研究等提供基因組學新思路和新方法。
產品優勢
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◇ 信息量大：多種微生物一次性捕獲，包括細菌、病毒，以及致病的寄生蟲，并且同時檢測多種突變信息。 |
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◇ 檢測周期短：高深度測序，測序周期短，快速鑒別不同種類的微生物。 |
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◇ 高性價比：相比核酸雜交、基因芯片、PCR等檢測技術，NGS具有高數據量、高準確性、高靈敏度、高自動化、 低成本等突出優勢。 |
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◇ 靈活定制：根據客戶需求進行個性化定制捕獲Panel。 |
技術路線
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樣本要求 |
DNA>1 μg，濃度25 ng/uL |
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捕獲平臺 |
TargetSeq® |
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測序策略 |
Illumina PE150，數據量根據檢測項目決定 |
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服務周期 |
第一輪測試數據（35個自然日）＋技術服務（15個自然日）=50個自然日 |
文獻案例
發表雜志：International Journal of Medical Microbiology IF：3.298 發表年份：2018
在英格蘭和威爾士，由于使用了抗生素，大約一半的實驗室確認的腦膜炎球菌病病例不能產生可侵襲性分離物。本研究證明了使用靶特異性寡核苷酸探針，來捕獲和富集血液和腦髓液標本中腦膜炎球菌DNA的能力。進行高通量測序后，在10個樣本中有8個樣本觀察到腦膜炎球菌DNA含量與基因組覆蓋率呈正相關。并且，非培養的病菌樣本與患者的分離樣本分型信息相匹配，配對基因組在索引位點上表現出高度的一致性。以英國的公共衛生腦膜炎球菌樣本數量為參考，使用這項技術后，約45%的陽性樣本可以進行全基因組測序。
圖1 腦膜炎球菌測序數據組裝與分析概述
參考文獻
Clark S A , Doyle R , Lucidarme J , et al. Targeted DNA enrichment and whole genome sequencing of Neisseria meningitidis directly from clinical specimens[J]. International Journal of Medical Microbiology Ijmm, 2018, 308(2):256.
