TCGA,The Cancer Genome Atlas Program,癌癥基因組圖譜計劃,該數據庫收錄了超過20000例患者,33類癌癥的大量數據,主要包括:
1,臨床數據。患者的一般信息,TNM分期,生存等
2,mRNA表達譜
3,miRNA表達譜
4,拷貝數變化
5,突變
6,蛋白質譜
7,甲基化
針對TCGA數據庫中的大量數據及相關的二次數據庫,我們可以對腫瘤數據進行挖掘:
1,差異表達分析
2,生存分析
3,腫瘤分期分析
4,免疫浸潤
5,泛癌分析
6,預后模型