腫瘤組織中并不是100%的細(xì)胞都是腫瘤細(xì)胞,還含有基質(zhì)細(xì)胞,成纖維細(xì)胞,免疫細(xì)胞等,這些細(xì)胞構(gòu)成了腫瘤微環(huán)境。
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腫瘤組織中并不是100%的細(xì)胞都是腫瘤細(xì)胞,還含有基質(zhì)細(xì)胞,成纖維細(xì)胞,免疫細(xì)胞等,這些細(xì)胞構(gòu)成了腫瘤微環(huán)境。 為了準(zhǔn)確評(píng)估腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞的構(gòu)成,我們可以使用cibersort對(duì)RNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)去卷積,以估計(jì)22種不同細(xì)胞類(lèi)型和功能狀態(tài)的免疫細(xì)胞的豐度。
結(jié)果展示1,每個(gè)樣品的22種免疫細(xì)胞占比
2,占比bar圖
3,熱圖
4,兩組比較的box圖