變性梯度凝膠電泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE) 利用由堿基序列所決定的DNA片段溶解度或變性度的差異，達到分離野生型與突變型DNA片段的目的，該手段分辨率達一個堿基。當DNA 雙鏈沿變性劑濃度梯度增加的聚丙烯酰胺凝膠遷移時，DNA分子中解鏈溫度(Tm) 低的部分逐漸變性解鏈。一般總是錯配堿基部分的異源雙鏈Tm最低，最容易解鏈，其次是富含AT 堿基對的部位，富含GC堿基對的部位Tm值較高所以解鏈較難。因此，正常DNA雙鏈和異源雙鏈在梯度變性膠中電泳時，異源雙鏈總是先解鏈。