菌種活化就是將保藏狀態的菌種放入適宜的培養基中培養，逐級擴大培養是為了得到純而壯的培養物，即獲得活力旺盛的、接種數量足夠的培養物。菌種發酵有一般需要2-3代的復壯過程，因為保存時的條件往往和培養時的條件不相同，所以要活化,讓菌種逐漸適應培養環境。要明白菌種活化的情況就需要了解菌種保藏的方式和方法。目前國際國內常用的菌種保存方法包括：定期移植法、液體石蠟法、沙土管法、真空冷凍干燥法、80℃冰箱凍結法、液氮超低溫凍結法。
 
對于不同的保存方式活化的方式也不同： 
1、定期移植法的菌種復蘇較簡單，直接轉接即可； 
2、液體石蠟法保存的菌種在復蘇時，挑取少量菌體轉接在適宜的新鮮培養基上，生長繁殖后，再重新轉接一次；
3、沙土管法保存菌種在復蘇時，在無菌條件下打開沙土管，取部分沙土粒于適宜的斜面培養基上，長出菌落后再轉接一次。或取沙土粒于適宜的液體培養基中，增殖培養后再轉接斜面； 
4、真空冷凍干燥法保存菌種在復蘇時先用70%酒精棉花擦拭安瓿上部，將安瓿管頂部燒熱，用無菌棉簽沾冷水，在頂部擦一圈，頂部出現裂紋，用挫刀或鑷子頸部輕叩一下，敲下已開裂的安瓿管的頂端，用無菌水或培養液溶解菌塊，使用無菌吸管移入新鮮培養基上，進行適溫培養；
5、-80℃冰箱凍結法保存菌種復蘇時，從冰箱中取出安瓿管或塑料凍存管，應立即放置38℃-40℃水浴中快速復蘇并適當快速搖動。直到內部結冰全部溶解為止，約需50秒-100秒。開啟安瓿管或塑料凍存管，將內容物移至適宜的培養基上進行培養；
6、液氮超低溫凍結法保存菌種復蘇與-80℃冰箱凍結法保存菌種復蘇相似，從液氮罐中取出安瓿管或塑料凍存管，應立即放置在38℃-40℃水浴中快速復蘇并適當搖動。直到內部結冰全部溶解為止，一般約需50秒-100秒。開啟安瓿管或塑料凍存管，將內容物移至適宜的培養基上進行培養。