隨著對生命體深入認知需求的不斷提升,生命科學研究正聚焦于更高分辨率及更高維度——即單細胞及空間水平。通過單細胞及空間組學,可以獲得樣本中每個細胞及其在組織空間位置上的分子表達水平,使得人們能夠更精準地針對細胞亞群或特定空間區域進行研究及后續干預。然而,您是否了解現階段有哪些主流的單細胞及空間組學技術呢?下面小編來為您盤點一番。
單細胞轉錄組
毫無疑問,單細胞轉錄組是這類技術中成熟最早,應用最為廣泛的技術。它解決了bulk轉錄組無法解析細胞異質性的問題,大幅推動了腫瘤、免疫、神經、發育等多個領域的研究。
主要解決問題
細胞亞群的組成及差異;
細胞亞群的基因表達圖譜及細胞間表達差異。
【中科新生命】單細胞轉錄組產品特色
采用10x Genomics 最新 Chromium X 平臺,獲得更高的細胞檢測通量及更穩定的性能;
數十種組織解離經驗及標準流程,包括FFPE組織、凍存組織等疑難樣本。
單細胞蛋白質組
蛋白質是執行生物功能的主要分子,也是現階段藥物研發的主要對象。同時,由于轉錄后調控的廣泛存在,同一基因的mRNA和蛋白表達狀態往往不一致。因此,單細胞蛋白質組研究有著其不可替代的意義。
以技術流派維度區分,細胞表面蛋白(CITE-seq)、質譜流式(CyTOF)等技術保留了單細胞轉錄組細胞通量高的優勢,但也存在明顯的缺陷:檢測蛋白數量少(~平均約數十個蛋白)且只針對特定靶向蛋白。
與此同時,近年來出現了一種新的技術流派SCoPE2-MS——基于微孔板收集制備單細胞蛋白溶液,通過高靈敏度質譜實現單細胞蛋白質組檢測。在此基礎上,中科新生命合作參與了該方法的優化研發,實現了在384孔板完成樣本制備(細胞分選-蛋白提取-酶解-TMT標記)一體化流程,可實現高達上千個細胞的單細胞蛋白質組學分析。
主要解決問題
高靈敏度的單細胞蛋白質組表達圖譜及細胞間蛋白表達差異。
超高蛋白檢測數量;
完善的樣本前處理及后續分析流程。
深度空間代謝組
空間組學是指在保持樣本原有空間位置分布的基礎上,對組織內各個位置進行高通量組學檢測的技術手段。深度空間代謝組主要利用質譜成像技術,實現空間水平高分辨率且能精準定位組織中的代謝物分布。對組織中的代謝異質研究、積累和調控機理至關重要。
主要解決問題
空間水平高分辨率靶向/非靶向代謝組檢測。
【中科新生命】深度空間代謝組產品特色
采用超高靈敏度基質輔助激光解吸電離技術(MALDI2),實現低至5µm的空間分辨率;
專業質譜成像及化合物定性軟件,保證分析可靠性;
提供組織切片-基質噴涂-上機檢測-數據分析完整解決方案。
空間轉錄組
目前,已有多種商業化技術手段可實現空間位置水平上轉錄組的檢測,例如:10x Genomics Visium、GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)等。為了滿足不同的研究需求,需要靈活選擇不同的技術進行檢測。
主要解決問題
空間水平細胞亞群分布;
空間水平基因表達圖譜及差異檢測。
【中科新生命】空間轉錄組產品特色
多平臺布局,可根據整體實驗方案靈活選擇;
全套組織切片-空間轉錄文庫構建-數據分析解決方案流程。
中科新生命正全力打造基于單細胞轉錄組、單細胞蛋白質組、空間轉錄組及空間代謝組的單細胞空間多組學檢測分析平臺。此外,該家族中一些新的技術產品,例如空間蛋白質組、單細胞代謝組也正處于公司的研發管線中,致力于為廣大科研工作著提供完整、高品質的單細胞空間多組學服務。
中科新生命單細胞及空間多組學產品陣列