“深度血液”輔助血液生物標志物開發
瀏覽次數:1091 發布日期:2022-11-8
來源:中科新生命
什么是生物標志物
血液是臨床最普遍的樣本類型,血液生物標記物被用于對患者進行分類和支持治療決策。然而,現有的生物標記物遠遠不夠全面,往往缺乏特異性,新的生物標記物的開發速度非常緩慢。基于質譜(MS)的蛋白質組學已經成為生物研究中的一項強大技術,它現在可以對血漿蛋白質組進行深度檢測。
生物標志物的篩選方法
傳統的“三角法”通過在小隊列中發現候選生物標志物,然后在更大的驗證隊列中進行下一步的驗證和確證。此外,
Matthias Mann等研究者還提出了一種“
矩陣法”,基于大隊列蛋白質組篩選和驗證同時分析,避免了傳統法樣本個體差異的缺陷,省時省力且更科學地解決問題。
DOI: 10.15252/msb.20156297
血液生物標志篩選難點
血液由于其蛋白分布動態范圍廣(跨越12個數量級)、蛋白含量分布不均勻(高豐度占比>90%),且質譜的靈敏度有限的原因(目前不做處理的質譜檢測范圍仍然高及中豐度蛋白為主),因此血液蛋白組學,尤其是發揮功能性作用的低豐度蛋白的檢測存在著極大的挑戰。
DOI: 10.15252/msb.20156297
“深度血液”數據分享
1、超高鑒定深度
中科新生命新推出的深度血液4D-DIA蛋白組采用最新的
富集方法+DIA全息掃描+ Spectronaut 16權威分析軟件,實現了血液中低豐度蛋白的超高深度鑒定。實測項目,鑒定蛋白數超
3000+,中低豐度蛋白覆蓋率約占
95%~。
此外,“深度血液”與其他傳統血液蛋白組學的方法比較分析,也顯示出了其高深度的特色。如下圖所示,“深度血液”的鑒定深度遠高于傳統血液蛋白組學——“去高豐度+DIA”和“去高豐度+TMT”,并且隊列樣本(n=40)覆蓋人類血漿蛋白質庫中高達
72%的蛋白。
https://www.proteinatlas.org/humanproteome/blood+protein
2.兼具超高穩定性、重復性與可靠性
“深度血液”采用DIA全息掃描模式,具有超高的穩定性和重復性。中科新生命的實測數據顯示,三次技術的定性重復性達
90%,定量相關性達
0.9,在色譜穩定性的評價中,多維度質控均達到了高標準的水平,進一步證實了結果的穩定性和可靠性。
定性重復性達 90% 定量相關性達 0.9
3. 項目經驗豐富,高分文獻發表10篇有余
中科新生命至今已經完成了
10000+樣本的質譜檢測,且樣本類型涉及血液、動植物組織、外泌體等多種類型,項目經驗豐富。近年來,中科新生命助力發表的DIA文獻已達
10篇有余,部分DIA客戶文獻請見下表。
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