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水德浮游生物大數據平臺的使用與數據分析方法

瀏覽次數:2709 發布日期:2020-5-9  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
水德浮游生物大數據平臺
 
目前,絕大多數海洋和淡水生態領域的研究機構和業務監測單位,對浮游生物的研究手段還停留在人工鏡檢及手工測定的階段,這樣經常導致操作過程繁瑣、工作量巨大、分析結果滯后,而且需要資深專業技術人員。

此平臺用于對浮游生物樣品進行快速安全清洗、掃描成像、種類鑒定、數量統計、大小測量、生物量測定等工作,可以讓相關研究機構和業務單位快速了解水域生態系統中的浮游生物在空間維度和時間維度上的分布和變化情況。

浮游生物大數據平臺主要包括以下四個組成部分:ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統(含專用電腦和ZooProcess軟件)、浮游生物甲醛快速清洗裝置、EcoTaxa云端大數據分析系統及國內云服務器。

一、ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統
ZooSCAN浮游動物圖像掃描分析系統是該平臺中的硬件部分,它主要用于對浮游動物樣品掃描,形成數字化的圖像。其自帶的軟件ZooProcess會以標準化的程序處理原始圖像并對不同個體的形態參數進行自動測量及計數。
ZooSCAN工作流程:

1)掃描空白背景;2)掃描樣品,獲得原始圖片和元數據信息;3)使用ZooProcess軟件,標準化原始圖片,提取并測量圖片中不同個體的形態參數;4)通過對形態學參數的提取與分析,可進一步獲得樣品的粒徑組成、生物學體積等信息(由EcoTaxa完成)。



ZooSCAN掃描結果:

ZooSCAN掃描得到的浮游動物圖片

測得的浮游動物形態學參數
 
ZooSCAN 規格:
  • 型號:ZSCA04
  • 規格 (LxWxH):60 x 54 x 36 cm (關上蓋子)
  • 質量:25 Kg
  • 輸入電壓:110 to 230 VAC, 50 to 60 Hz
  • 接口:USB 2.0
  •  
二、浮游生物甲醛快速清洗裝置
 

 
甲醛快速清洗裝置是一套專業的工具,專門用來清洗使用福爾馬林保存的浮游生物樣品中的甲醛成分,跟傳統清洗方法相比,此裝置更加安全、快速、高效。
甲醛快速清洗裝置采用AISI 316不銹鋼制成,配6個相互獨立的圓柱形清洗器,每個清洗器容積約2L,可單獨拆卸。每個清洗器配有1個獨立開關,可單獨控制水流出入。
每個清洗器側面有一個矩形小孔,裝有500μm(可定制,最小20μm)孔徑的不銹鋼網篩。每個清洗器有1個手柄,保證使用時的方便和安全。
頂部是1個焊接上的圓環,直徑180mm,圓環上安裝了一個網目500μm的不銹鋼篩網。底部直徑10mm,有3個直徑3mm的圓孔,圓孔上裝有網目500μm的不銹鋼篩網。清洗器通過1個閥門連接在2mm的AISI 316不銹鋼架上。一個進水接頭,一個出水接頭。

三、EcoTaxa云端大數據分析系統

EcoTaxa云端大數據分析系統是一個浮游生物數據庫共享平臺,主要致力于對浮游生物圖片進行高效地自動鑒定、分類和統計。它的數據庫完全獨立,專門為中國用戶建立,使用者可以在該網站上瀏覽、上傳浮游生物圖片或創建浮游生物數據庫。其分類速度快、數據保有量大、系統樹完整,因此受到了廣大浮游生物分類學專家們的青睞。
 
EcoTaxa云端大數據分析系統主界面
 
EcoTaxa云端大數據分析系統通常配合ZooSCAN一起使用。將通過ZooSCAN獲得的浮游生物圖片和相關信息上傳到EcoTaxa后,用戶可以利用網站上已有的或自己新創建的數據庫快速對圖片中的浮游生物種類進行自動鑒定、分類,再從EcoTaxa中將鑒定的結果導出,用于統計該批浮游生物具體的分類學數據。這樣大大地提高了物種分類的效率,能夠幫助用戶們節省寶貴的科研時間。此外,數字化的圖片及分類保存形式,方便使用者日后對項目進行檢索、調用。
 
EcoTaxa云端大數據分析系統檢索界面
EcoTaxa云端大數據分析系統項目分類界面
EcoTaxa云端大數據分析系統導出鑒定結果
EcoTaxa云端大數據分析系統數據處理速度更加快速、界面簡潔、易于操作且功能強大,定能協助浮游生物研究人員取得更加豐碩的科研成果。同時,幫助國內水域生態監測單位,快速獲得浮游生物數據,通過研究浮游生物的生物量變化來及時的了解對應水域生態環境的變化情況。

水德浮游生物大數據平臺的特性:
  • 應用(專):專門用于浮游生物研究
  • 功能(強):自動對浮游生物鑒定、分類、計數、計算生物量
  • 效率(高):快速批量分析大量浮游生物樣品
  • 信息量(大):經緯度、采樣深度、網型、網口面積等
  • 照明系統(優):確保圖像質量和對比度最佳
  • 圖像解析度(高):最高可達4800dpi
  • 圖像分辨率(高):14150 x 22640 (3.2億像素,1GB)
  • 數據分析緯度(大):空間維度和時間維度
  • 深度學習能力(強):隨著數據量的增加,圖像識別率會逐步提升
 
水德浮游生物大數據平臺的應用:
  • 浮游生物自動鑒定、計數、分類
  • 水域生物量計算分析
  • 水域生態災害應急監測
  • 水域生態數據統一管理
  • 特定水域生態系統演變監測和預測
  • 不同水域生態系統關系分析
  • 漁業資源評估和預測
 
水德浮游生物大數據平臺能夠高效地幫助用戶處理和分析大批量的浮游生物樣品,并快速獲得用戶需要的浮游生物分類學信息以及浮游生物時空分布信息,為科研人員的學術研究和政府部門的決策提供快速、全面的數據支撐。
來源:青島水德科技有限公司
聯系電話:15376906221
E-mail:yj.jia@watertools.cn

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