1.未開封的干粉培養基保質較長，已開封的保質期會變短。在瓶體上注明開封日期，用后擰緊瓶蓋。個別品種易變質，如SC增菌液，可冷藏保存。
2.若干粉培養基結塊或顏色發生改變，不得使用。
3.配制用水可用蒸餾水、去離子水等，電阻率不小于30萬Ω•cm，每批應檢查一次。
4.稱量干粉培養基時為避免污染，可用專用角匙。
5.自行配制的培養基，各營養成分應按要求順序加入，避免產生沉淀。
6.盛放培養基的容器不宜用銅或鐵鍋，以防其離子混入培養基影響微生物生長。
7.稱量好的干粉培養基應先溶解再高壓滅菌。
8.自行配制的培養基應完全溶解后再調PH。PH值須冷后測定，因培養基所含成分不同，對冷的和熱的進行測定，其PH值相差很多。培養基的PH值須精確測定，否則會影響微生物的生長和反應地觀察。另外，PH值不可反復調試，否則會影響培養基的滲透壓。
9.需要加熱煮沸的培養基應避免溢出，應邊攪拌邊加熱。燒糊的培養基，其成分已改變，不得使用，應重配。
10.不須高壓滅菌的培養基，配制用水及盛放的容器可于配制前先進行高壓滅菌。
11.配制好的培養基一般采用高壓滅菌，且應立即滅菌，以防微生物生長消耗養分而改變培養基成分。
12.壓力蒸汽滅菌器應定期檢定，平時可用生物指示菌法和化學變色紙片進行滅菌驗證。滅菌時應注意排除冷空氣。含糖或特殊培養基應按要求選好滅菌溫度及時間。
13.滅菌后的培養基應迅速冷卻到所須溫度，避免長時間保存在滅菌鍋中，造成過度滅菌，影響培養基的營養成分或選擇性效果。
14.配制的培養基的量應恰當，未用完的可注明配制日期，并且應該在最長保值期內用完。配好的培養基應避光、冷藏保存防止蒸發。
15.凡受污染長過細菌的培養基，不得滅菌再用。
16.三(雙)糖鐵瓊脂斜面試管塞不宜塞的過緊，否則容易影響斜面堿性反應;LST如果試管塞過緊，影響排氣，可導致滅菌后小倒管內仍有氣泡。
17.需要加添加劑或抗生素的培養基應即配即用。
18.固體培養基如儲存太久，使用前應再加熱一次，使其表面濕潤以利細菌生長。