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新冠病毒迭代進化、變異情況及毒株之間的關系

瀏覽次數:51 發布日期:2025-4-25  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

自2020年起,COVID-19大流行成為21世紀最嚴重的全球性公共衛生危機之一,它不僅導致了全球范圍內的生命損失和健康問題,還引發了經濟衰退、就業市場動蕩、心理健康危機等。

圖1 SARS-CoV-2結構

新冠病毒顆粒呈圓形或橢圓形,主要包括:刺突糖蛋白(Spike Protein, S)、核衣殼(Nucleocapsid, N)、膜糖蛋白(Membrane Glycoprotein, M)、包膜蛋白(Envelope Protein, E)和RNA基因組。膜糖蛋白和包膜蛋白,對病毒的形態功能和組裝釋放相關。

S蛋白、N蛋白和RBD(受體結合域)是病毒的關鍵組成部分,它們在病毒的感染機制、免疫反應和疫苗開發中發揮著重要作用。

圖2 刺突糖蛋白結構

S蛋白由S1和S2兩個亞基組成。S1亞基包含RBD,負責與宿主細胞表面的ACE2受體結合,而S2亞基則參與病毒與宿主細胞膜的融合過程。S蛋白的RBD區域決定了病毒對宿主細胞的特異性和感染力。

N蛋白以串珠的形式結合到RNA基因組上,形成螺旋對稱的核衣殼結構,與病毒RNA相互作用形成核糖核蛋白復合體(RNP),是病毒的核心。在病毒的復制和轉錄過程中發揮重要作用,并且參與病毒的組裝過程,N蛋白也是疫苗設計和藥物開發的潛在靶點。

病毒進化
隨著病毒序列不斷發生突變,新的變體不斷出現,病毒進化產生的新毒株可能具有更高的逃逸能力、傳播能力或可能加重重癥風險。面臨這些挑戰我們也必須做出快速響應,持續監測病毒變異情況以及治療方法。

圖3 新冠基因組主系進化關系示意圖

KP.2   
KP.2(JN.1.11.1.2)是新冠病毒奧密克戎JN.1變異株的第三代亞分支,也是JN.1變異株中具有較強傳播優勢的一個亞分支。KP.2的有三個新增變異位點,其中兩個在S蛋白上。

KP.2擁有更高的病毒適應度,可能成為世界范圍內的主要譜系。根據基因組檢測數據評估發現KP.2的相對有效繁殖數Re在USA、UK和加拿大,KP.2的Re分別是JN.1的1.22倍、1.32倍和1.26倍。截止2024年4月,UK估計KP.2的變異頻率已經高達20%。使用BXX1.5疫苗血清和XBB.1.5、EG.5、HK.3和JN.1突破感染患者血清進行中和滴度檢測,發現KP.2的逃逸能力也遠高于JN.1。WHO在5月3日將KP.2列入“需要檢測的變異株”。

除KP.2外,BA.2.75、BA.4、BA.5、XBB和JN.1也是一些備受關注的變異株。BA.2.75具有多個關鍵的S蛋白突變,特別是受體結合域(RBD)的突變,有較高的ACE2結合親和力;BA.4和BA.5具有高逃逸特性已成為多個國家和地區的主要流行株;XBB是新冠病毒奧密克戎變異株的一個特殊亞型,屬于重組變異株,它們可能由兩種或以上的病毒株的遺傳物質組合而成;而JN.1是BA.2.86的新型變體,繼承了BA.2.86的抗原多樣性和額外的L455S突變,JN.1可通過降低與ACE2的結合來實現更高的免疫逃避能力,世衛組織也將JN.1單獨列為需留意的新冠變異株。

S-RMab®蛋白
斯達特也一直關注病毒迭代進化,上新近40款新冠蛋白與抗體,覆蓋新冠KP.2、JN.1、XXB等多種流行病株,為新冠研究提供核心原料。

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參考文獻
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