在藥物研發(fā)的漫漫征途中,分子間相互作用的定量分析至關重要,快速尋找能夠精準結合目標分子的小分子抑制劑或促進劑,一直是科學家們不懈追求的目標。傳統(tǒng)的高通量篩選(HTS)技術雖能快速篩選大量化合物,但往往只能提供定性或半定量的結果,且存在大量假陽性和假陰性。傳統(tǒng)定量方法(SPR, BLI, ITC)通常需要重復測量稀釋系列,以便生成滴定曲線并測量平衡解離常數(shù)(Kd),但這些方法受限于它們在幾十分鐘范圍內(nèi)的中低通量能力,才可獲得單個配體的解離常數(shù)。其中表面等離子共振(SPR)、生物層干涉法(BLI)雖然能夠提供詳細的結合親和力和動力學信息,但基于表面的技術,需要復雜的表面化學優(yōu)化,且對緩沖液兼容性和分析物的表面吸附敏感;等溫滴定量熱法(ITC)雖然是溶液中的技術,但需要大量的樣品,對于珍貴或稀有的材料不夠實用,這些限制促使科學家們尋找更高效、更通用的分析技術。如今,一種名為cSPRING(Continuous Titration Based Spectral Related Intensity Change)的新興技術,它將FIDA(層流誘導分散分析)與光譜位移技術相結合,以在單個濃度樣品中測量Kd,作為一種溶液內(nèi)方法,可將樣品制備時間減少8倍,并且僅需要納克蛋白質。cSPRING可在一分鐘內(nèi)通過單濃度樣品測量Kd,突出了其效率和篩選應用的潛力,有望對傳統(tǒng)小分子定量篩選市場這一領域帶來新的曙光。
技術原理
在深入了解 cSPRING 的優(yōu)勢之前,我們先來剖析兩種技術——cSPRING 和 dSPRING 的實驗設計和原理。在 dSPRING(離散滴定法)中,研究人員需要準備一系列不同濃度的分析物溶液,通常通過 2 倍稀釋系列來實現(xiàn)。每個濃度點都需要單獨測量,生成完整的滴定曲線。實驗中,熒光標記的指示劑(如蛋白質)與不同濃度的配體混合后,通過Capflex方式進行檢測。熒光信號呈高斯分布,通過雙高斯擬合提取擴散系數(shù)和熒光強度,最終得到平衡解離常數(shù)(Kd)(Figure 1A)。
cSPRING(連續(xù)滴定法)技術基于FIDA(層流誘導分散分析)與光譜位移技術,通過在毛細管中自動創(chuàng)建連續(xù)的濃度梯度,實現(xiàn)對非共價相互作用的快速定量分析。具體來說,F(xiàn)IDA利用層流條件下熒光溶質的濃度分布,精確測定擴散系數(shù)和流體動力學半徑。而cSPRING結合了FIDA和光譜位移檢測,通過測量熒光團的發(fā)射光譜變化來反映分子間相互作用。實驗中只需準備兩個樣品:一個是完全結合狀態(tài)(高濃度分析物與指示劑混合),另一個是未結合狀態(tài)(僅指示劑)。通過在毛細管中自動創(chuàng)建連續(xù)的濃度梯度,模擬傳統(tǒng)的滴定曲線。配體在毛細管中以泰勒分散的方式形成時間依賴的濃度分布,而指示劑濃度保持恒定(Figure 1B)。
Figure 1 的展示,我們可以清晰地看到 cSPRING 和 dSPRING 在實驗設計上的關鍵區(qū)別。dSPRING 更適合高精度的詳細分析,而 cSPRING 則以其高效、快速的特點,成為高通量篩選的理想選擇。
應用案例
文章中,研究人員選擇了雞卵清溶菌酶(HEWL)與三乙酰氨基葡萄糖(NAG3)作為模型體系。HEWL被標記上對環(huán)境變化敏感的Cy5熒光染料,當NAG3與HEWL結合時,熒光團的微環(huán)境發(fā)生變化,導致其發(fā)射光譜的比率變化。通過在兩個光譜帶(λ1=663–685 nm和λ2=685–737 nm)中測量熒光強度的比率(F2/F1),研究人員能夠實時監(jiān)測結合過程。
Figure 2 展示了cSPRING技術在HEWL-NAG3體系中的應用。圖2A是一個dSPRING離散滴定曲線,顯示了在不同NAG3濃度下,HEWL與NAG3結合的比率熒光信號變化,擬合得到的Kd值為7.2±0.7 μM,與文獻報道的10 μM非常接近。圖2B則展示了cSPRING實驗中記錄的熒光信號,通過擬合得到的Kd值為10.4±0.8 μM,與dSPRING的結果一致。圖2C進一步驗證了cSPRING的重復性和可靠性,三次重復實驗的Kd值高度一致,平均值為10.4±0.8 μM。
為了進一步驗證 cSPRING 技術的高效性和準確性,研究人員選擇了牛碳酸酐酶 II(bCAII)作為模型體系。bCAII 是一種廣泛研究的酶,它與多種小分子抑制劑的相互作用已被詳細表征。
Figure 3 則展示了cSPRING技術在牛碳酸酐酶II(bCAII)與三種不同抑制劑(乙酰唑胺、呋塞米、4-羧基苯磺酰胺)體系中的應用。這些抑制劑的Kd值范圍從20 nM到1 μM,cSPRING技術能夠快速、準確地測定這些結合親和力,并與文獻報道的值高度一致。
Table 1 的數(shù)據(jù)表明,cSPRING 和 dSPRING 在測量非共價相互作用的解離常數(shù)(Kd)時具有高度一致性和可靠性。cSPRING 以其快速、高效、節(jié)省樣品的特點,特別適合高通量篩選和初步評估,而 dSPRING 則適合對單個體系進行更詳細的分析。這些方法與傳統(tǒng)技術(如 SPR 和 ITC)的比較進一步驗證了 cSPRING 的實用性和準確性。
為了進一步突出定量篩選能力,研究人員在更短的毛細管上進行 cSPRING 實驗,且無需額外的清洗步驟,這使得單個平衡解離常數(shù)(Kd)值的測量時間縮短至 45 秒(圖 4)。結果,對三種抑制劑進行三次重復測量用時不到 7 分鐘,每種抑制劑僅消耗 4.2 微升指示劑溶液。
Figure 4 在更短的毛細管中進行的 cSPRING 實驗,將單次測定平衡解離常數(shù)(Kd)的測量時間縮短至 45 秒。A - C 展示了三種不同抑制劑的 cSPRING 信號,以及擬合得到的平衡解離常數(shù)(Kd)和流體動力學半徑。盡管結果的準確性降低,但定量讀數(shù)提供了有價值的信息,并且仍與先前報道的親和力相符。
cSPRING的優(yōu)勢
結論
cSPRING技術以其高效、快速、精準的特點,為非共價相互作用的定量分析提供了一種全新的解決方案。它不僅大大減少了樣品準備時間和實驗成本,還能夠提供與傳統(tǒng)方法相媲美的準確結果。對于藥物研發(fā)中的高通量篩選和定量分析,cSPRING無疑是一個極具潛力的工具。
參考文獻
Philipp Willmer et al. "Continuous Titration Based Method for Rapid In‐Solution Analysis of Non‐Covalent Interactions." Chemistry Methods 2025.