英文題目:
Dissecting the genetic architecture of key agronomic traits in lettuce using a MAGIC population
發表期刊:Genome biology
發表時間:2025年3月23日
影響因子:10.1
共同通訊作者:匡漢暉、魏桐、楊萬能
共同第一作者:陳宏運、陳炯炯、翟瑞芳
作者單位:華中農業大學、武漢華大生命科學研究院
本研究構建的生菜MAGIC群體因無顯著群體結構,以及高分辨率定位能力,可高效解析生菜復雜農藝性狀的遺傳調控基礎。已鑒定的位點和候選基因為萵苣農藝性能與葉片品質改良提供了重要遺傳資源,為生菜的設計育種奠定基礎。
Genome Biology | 華中農業大學萵苣團隊構建全球首個生菜多親本遺傳群體
英文題目:
Integrative phenomics, metabolomics and genomics analysis provides new insights for deciphering the genetic basis of metabolism in polished rice
發表期刊:Genome biology
發表時間:2025年3月12日
影響因子:10.1
共同通訊作者:楊萬能、羅杰、余樂俊
共同第一作者:馮慧、李宇飛、戴國新、楊壯
參與人員:Luis A. J. Mur、陳偉、楊陳坤
作者單位:華中農業大學、海南大學、崖州灣國家實驗室
該研究將高光譜成像技術與機器學習相結合,開發出高通量、低成本的水稻精米代謝物預測方法,成功實現了對黃酮、脂質,氨基酸等關鍵代謝物的快速檢測。
Genome biology | 谷豐光電首席科學家楊萬能團隊聯合海南大學/崖州灣國家實驗室羅杰團隊揭示水稻精米代謝遺傳基礎
英文題目:
RPT: An integrated root phenotyping toolbox for segmenting and quantifying root system architecture
發表期刊:Plant Biotechnology Journal
發表時間:2025年3月12日
影響因子:10.1
共同通訊作者:楊萬能、樓巧君
共同第一作者:施家偉、謝尚源、李為坤
作者單位:華中農業大學、浙江省農業科學院
該研究構建了一套基于深度學習的高通量根系表型智能分析技術—RPT(Root Phenotyping Toolbox),并結合自主研發的高通量作物根系表型平臺,實現了水稻根系表型動態無損提取及抗旱基因的精準挖掘。
PBJ | 谷豐光電首席科學家楊萬能團隊聯合浙江農科院樓巧君團隊研發高通量根系表型智能解析技術
英文題目:Phenomics-assisted genetic dissection and molecular design of drought resistance in rice
發表期刊:Plant Communications
發表時間:2025年3月10日
影響因子:9.4
共同通訊作者:羅利軍、楊萬能
共同第一作者:樓巧君、陳韻宇、王鑫
作者單位:上海市農業生物基因中心、華中農業大學
本研究為多模態和時間序列表型分析提供了有價值的參考,為解析水稻避旱性和耐旱性的遺傳機制提供了重要線索,也為節水抗旱稻的分子育種提供了科學指導和精準定位依據。
谷豐光電高通量作物表型平臺助力上海市農業生物基因中心、華中農業大學邁上抗旱水稻育種研究新臺階
英文題目:
Integrating Dynamic High-Throughput Phenotyping and Genetic Analysis to Monitor Growth Variation in Foxtail Millet
發表期刊:Plant Methods
發表時間:2024年11月5日
影響因子:4.7
共同通訊作者:孫朝霞、韓冀皖、侯思宇
共同第一作者:王振宇、郝炅煜
參與人員:韓淵懷、Luis A.J. Mur、李富忠、張吳平、史小凡、王巧巧
作者單位:山西農業大學
本研究構建了一種基于高通量成像系統的谷子動態監測模式,為精準表型測量提供了新方法,并通過GWAS識別出與谷子生長特征相關的關鍵基因,為谷子品種改良和糧食安全奠定了技術基礎,展現了HIS在谷子動態監測中的潛力,通過精準的表型數據獲取,為農作物育種和基因挖掘提供了有效工具。
谷豐光電高通量作物表型平臺助力山西農業大學雜糧分子育種團隊新研究 | 谷子動態高通量表型鑒定與重要農藝性狀關聯分析
英文題目:
Accurate rice grain counting in natural morphology: A method based on image classification and object detection
發表期刊:Computers and Electronics in Agriculture
發表時間:2024年12月1日
影響因子:7.7
通訊作者:宋鵬
共同第一作者:孫劍、賈浩洋
作者單位:華中農業大學
這項研究表明,使用穗的雙面圖像并不能顯著提高計數準確率。這項研究代表了在水稻穗自然形態內實現精確高效計數的成功嘗試,為檢測和計數密集物體提供了一種新穎的解決方案。
華中農業大學宋鵬副教授團隊:自然形態稻粒精確計數:一種基于圖像分類和物體檢測的方法
英文題目:
Integrative multi-omics analysis reveals genetic and heterotic contributions to male fertility and yield in potato
發表期刊:Nature Communications
發表時間:2024年10月5日
影響因子:14.7
共同通訊作者:黃三文、張春芝、楊萬能
共同第一作者:李大偉、耿澤棟
作者單位:中國農業科學院深圳農業基因組研究所、華中農業大學
該研究通過高通量的表型組學技術揭示馬鈴薯遺傳結構,闡明了二倍體馬鈴薯雜交種“優薯1號”雜種優勢的遺傳機理,為馬鈴薯功能基因挖掘與雜交育種奠定了堅實的基礎。
高通量表型組技術助力馬鈴薯育種突破:揭示雄性育性與產量遺傳機制
英文題目:Autonomous navigation method based on RGB-D camera for a crop phenotyping robot
發表期刊:Journal of Field Robotics
發表時間:2024年6月30日
影響因子:4.2
通訊作者:宋鵬
共同第一作者:黃成龍、楊蒙
作者單位:華中農業大學
該研究提出了一種基于RGB-D相機的作物表型機器人自主導航方法,該方法建立了田間和盆栽兩種場景下多種作物圖像的導航數據集,采用實時性與準確性均衡的語義分割模型對作物區域進行分割,結合該區域深度信息,在真實世界坐標系下提取導航線并獲得導航參數,再根據兩個單輸入輸出模糊控制器對機器人實施糾偏控制。除此之外,該方法根據識別區域內作物的平均高度和區域內目標的存在性判別機器人是否到達行末,最終根據行走時所測得的行距,控制機器人在末尾自動換行。
華中農業大學基于RGB-D相機的作物表型機器人自主導航方法
英文題目:
Integrating high-throughput phenotyping and genome-wide association studies for enhanced drought resistance and yield prediction in wheat
發表期刊:New Phytologist
發表時間:2024年7月11日
影響因子:8.3
共同通訊作者:宋純鵬、周云
共同第一作者:張震、曲云峰、麻菲菲
參與人員:黃錦嶺、楊萬能、馮慧
作者單位:河南大學
通過深度學習算法,研究者建立了小麥抗旱、高產預測模型。本研究不僅為基于高通量表型組,并結合基因組和轉錄組等多組學技術,以及基因編輯技術快速挖掘小麥抗旱基因并驗證其功能提供了參考,同時對利用系統的表型組技術篩選、鑒定和培育作物抗旱種質提供了重要的研究思路和全新研究模式。
谷豐光電高通量作物表型平臺助力宋純鵬團隊小麥抗旱研究新突破-高通量表型分析助力抗旱育種
英文題目:
IHUP: An Integrated High-Throughput Universal Phenotyping Software Platform to Accelerate Unmanned-Aerial-Vehicle-Based Field Plant Phenotypic Data Extraction and Analysis
發表期刊:Plant Phenomics
發表時間:2024年5月15日
影響因子:7.6
通訊作者:張建
第一作者:王博韜
作者單位:華中農業大學
論文通過水稻干旱相關案例講解和展示了該平臺的表型分析和提取過程,以及性能。結合水稻卷葉指數(LRS)預測模型,在多期連續監測數據中高效地提取葉片卷葉指數、株高、VIs、鮮重及干重等性狀。在該實例中,平臺每分鐘可從約500個小區中21個與干旱密切相關的表型參數。此外,該平臺還配備用戶友好界面,并支持定制或整合各種特征提取算法,較好的降低了非專業人士的學習和使用成本,加速了表型信息的提取效率和準確性。
華中農業大學開發了基于無人機平臺的大田作物表型數據提取和分析平臺
英文題目:
Maturity classification of rapeseed using hyperspectral image combined with machine learning
發表期刊:Plant Phenomics
發表時間:2024年3月26日
影響因子:7.6
通訊作者:廖宜濤
第一作者:馮慧
作者單位:華中農業大學
該研究論文探討了油菜籽成熟度分類問題,種子成熟度對于提高產量和促進育種研究至關重要。傳統的成熟度分類方法由于其繁瑣和破壞性而受到限制。研究采用高光譜成像(HSI)結合機器學習算法成功構建了一種非破壞性的分類模型。
華中農業大學基于高光譜圖像與機器學習對油菜籽的成熟度進行分類研究
英文題目:
A platform for whole-genome speed introgression fromAegilops tauschiito wheat for breeding future crops
發表期刊:Nature Protocols
發表時間:2023年11月28日
影響因子:13.1
共同通訊作者:宋純鵬、周云
共同第一作者:李浩、朱樂樂、范芮曉
作者單位:河南大學
該研究創建了一個系統、標準化的節節麥優良基因資源高通量快速漸滲到小麥的技術體系(A-Wi)和平臺。本研究不僅為實現小麥D基因組的從頭馴化,拓展小麥D亞基因組遺傳多樣性,研究D亞組的基因功能提供了系統、全面、切實可行的技術路線,更為重要的是為現代小麥品種改良創制了重要的全新種質材料,將小麥遺傳改良帶入新階段。此外,本研究研發的A-Wi技術平臺同樣適用于棉花、油菜等其他多倍體作物,為這些作物實現野生近緣種的全基因組滲入和遺傳改良提供了很好的方法學基礎。
谷豐光電高通量作物表型平臺助力宋純鵬團隊發展節節麥-小麥漸滲(A-Wi)平臺和技術體系
英文題目:
A Strategy for the Acquisition and Analysis of Image-Based Phenome in Rice during the Whole Growth Period
發表期刊:Plant Phenomics
發表時間:2023年6月8日
影響因子:7.6
共同通訊作者:胡偉娟、楊萬能
共同第一作者:湯芷歆、陳倬
參與人員:遺傳發育所陳凡研究組/降雨強研究組
作者單位:中國科學院遺傳與發育生物學研究所、華中農業大學
本文所開發的基于圖像的水稻表型獲取和分析策略為整個生育期作物表型的提取和分析提供了一種新的方法和不同的思考方向,從而為未來水稻的遺傳改良提供有用的信息。
Plant Phenomics│作物表型組學研究中心在水稻全生育期表型分析方法研究中取得進展
英文題目:A Novel Intelligent System for Dynamic Observation of Cotton Verticillium Wilt
發表期刊:Plant Phenomics
發表時間:2023年1月10日
影響因子:7.6
共同通訊作者:宋鵬、朱龍付
第一作者:黃成龍
參與人員:楊萬能
作者單位:華中農業大學
本研究展示了一種新型的棉花黃萎病動態觀測系統,該系統能夠準確、高效識別棉花黃萎病和健康葉片,并量化不同品種的動態患病率,為棉花智能育種和抗病研究提供了一種有效、可靠的工具。
轉載:Plant Phenomics | 華中農業大學作物表型團隊研制了一種用于棉花黃萎病動態監測的智能化系統
發表期刊:上海農業學報
發表時間:2022年7月30日
通訊作者:樓巧君
第一作者:高歡
作者單位:上海市農業生物基因中心、華中農業大學
WDR表型平臺可獲取很多有效的與水分脅迫反應相關的圖像表型數據,如冠層溫度、生物量、葉片顏色形態等基于圖像的性狀,這點在以往不同作物研究中也有論述。但是基于數字圖像提取水分脅迫后相應的圖像特征(i-traits),有些無法與傳統的水稻抗旱農藝性狀直接對應,如何正確解讀i-traits,挖掘出真正對抗旱功能基因組研究有價值的量化性狀,是水稻抗旱表型組學發展的關鍵所在。同時,由于表型采集技術的快速發展,即使只針對單個物種,表型組檢測也會產生海量數據集。在今后相當長的時間內,圖像分析及數據解析方法仍然是新一代植物表型組學發展的瓶頸,因此,認為只要購買了先進表型儀器就能完成整個表型組測量、數據分析和生物信息挖掘等,是對表型組學研究的誤解。
節水抗旱稻專刊 | 節水抗旱稻高通量表型組學研究平臺的建設與應用
英文題目:
High-throughput phenotyping-based QTL mapping reveals the genetic architecture of the salt stress tolerance of Brassica napus
發表期刊:Plant, Cell & Environment
發表時間:2022年11月10日
影響因子:6.1
共同通訊作者:楊萬能、郭亮、馮慧
第一作者:張國方
參與人員:劉克德
作者單位:華中農業大學
本研究結合高通量表型組和QTL-mapping等技術,鑒定到大量與鹽脅迫響應相關圖像性狀及調控候選基因,對甘藍型油菜耐鹽育種具有重要的參考和應用價值,為挖掘作物相關性狀候選基因提供了一種新思路和方法。
華中農業大學楊萬能郭亮課題組合作揭示甘藍型油菜耐鹽性的遺傳機制
英文題目:
Panicle Ratio Network: A high-throughput dynamic phenotype recognition model based on ultra-high-definition unmanned aerial vehicle images for rice panicle analysis in fields
發表期刊:Journal of Experimental Botany
發表時間:2022年7月1日
影響因子:5.6
通訊作者:張建
第一作者:郭子越
參與人員:陳國興、楊萬能
作者單位:華中農業大學
該研究針對對于水稻產量具有重要意義的抽穗期和有效分蘗率,建立了一個可以代替田間人工調查的多尺度田間抽穗情況評估模型。可以預見,運用無人機圖像進行作物表型分析將是未來的一大主流趨勢,除本實驗所研究的水稻外,對于其他作物也會有優秀的表現。
JXB | 華中農業大學作物表型團隊利用無人機表型平臺為水稻田間抽穗性狀高通量動態評估提供了新方法
福建省農業科學院
作物室外表型采集系統(一期龍門)
福建省農業科學院
溫室龍門表型采集系統(二期龍門)
上海農業生物基因中心
田間高通量植物表型平臺
中國熱帶農業科學院菠蘿良種表型平臺
未來,谷豐光電將繼續各高校、科研機構持續深化合作,致力于推動作物表型技術的創新與應用,為農業科研和育種提供更高效、精準的解決方案。通過技術賦能,共同為糧食安全和農業可持續發展貢獻力量。