DNA羥甲基化測序（hMeDIP-Seq）服務

 DNA羥甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾，對基因的表達起調控作用，在神經分化和癌癥中發揮重要的作用。為深入了解5hmC的作用，我們就必須清楚5hmC在基因組的分布情況。然而，傳統的基于重亞硫酸鹽的方法無法區分5-hmC和5-mc。5-hmC單克隆抗體捕獲法是研究DNA羥基化修飾的利器，結合高通量測序技術以及生物信息分析，可以獲得全基因組羥甲基化分布圖，從而能幫助我們從一個新的角度來解析胚胎發育，神經細胞分化以及癌癥發生的分子機制。

DNA羥甲基化測序技術優勢

*  特異性檢測羥甲基化： 5-hmC抗體能夠區分甲基化和羥甲基化信號，特異性的檢測羥甲基化區域。

*  靈活度高：能夠直接對任意物種的高羥甲基化片段進行測序，無需已知的基因組序列信息。

*  檢測范圍廣：覆蓋整個基因組范圍的羥甲基化區域。

*  精確度高：能夠在實際結合位點50個堿基范圍內精確定位。

*  數字化信號：直接對羥甲基化片段進行測序和定量，不存在傳統芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題。

康成生物提供的DNA羥甲基化測序服務流程
1.  羥甲基化DNA免疫共沉淀（hMeDIP）

2.  測序文庫構建

3.  DNA成簇（Cluster）擴增

4.  高通量測序

5.  數據分析

6.  提供實驗報告

康成hMeDIP-seq技術服務優勢

*  hMeDIP富集效果特異性佳：hMeDIP是獲得準確測序數據的關鍵�？党蒱MeDIP平臺經過不斷地優化，抗體富集效率高和特異性好。

*  嚴格的質控體系：康成生物在hMeDIP-seq每個關鍵步驟都加入了 質控實驗（圖2，3）。這些QC數據能夠評估每個步驟的質量。如果達不到標準，我們會重復實驗步驟或者優化實驗體系，使得每個樣品都能夠順利進入下個實驗環節。

圖2. hMeDIP-seq技術服務流程和關鍵步驟的質量控制

圖3. hMeDIP-qPCR 質控。hMeDIP特異地富集羥甲基化的Spike-in序列，且陽性信號遠高于背景噪音。

*  優化的文庫制備流程: 起始量少至1μg乃至更少量的起始DNA樣品即可進行羥甲基化測序實驗；同時，對hMeDIP富集過程及測序文庫嚴格的質量監控保證了高品質的測序結果。

*  對DNA羥甲基化水平進行數字化定量分析：通過對測序得到的大量序列進行深入分析，hMeDIP-seq得到的序列信息能夠轉換為可定量的羥甲基化水平信息。對基因組任意區域的羥甲基化水平給出定量的結果，并分析差異羥甲基化的區域。

*  可視化分析: 提供50bp精度的全基因組DNA羥甲基化信號可視化數據。通過UCSC基因組瀏覽器（UCSC genome browser），任意區域的羥甲基化水平能夠直觀的進行展示和比較。
 

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