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SNP是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異(單堿基的轉(zhuǎn)換、顛換、插入或缺失等)所引起的DNA序列多態(tài)性,在人群中的發(fā)生頻率不小于1%。
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概念和原理
SNP是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異(單堿基的轉(zhuǎn)換、顛換、插入或缺失等)所引起的DNA序列多態(tài)性,在人群中的發(fā)生頻率不小于1%。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種,發(fā)生頻率較高,大約平均每1000個(gè)堿基中就有一個(gè)多態(tài)位點(diǎn),被認(rèn)為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳標(biāo)記。常用檢測(cè)方法有PCR測(cè)序法、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性法( RFLP)、單鏈構(gòu)象多態(tài)性檢測(cè)(SSCP]等。
科研和臨床應(yīng)用
可用于:疾病相關(guān)基因的鑒定;疾病高危群體的篩選;藥物靶點(diǎn)個(gè)體差異性分析,指導(dǎo)個(gè)性化治療;法醫(yī)學(xué)中犯罪身份的鑒別,親子鑒定等:物種進(jìn)化研究等各種領(lǐng)域。
標(biāo)本采集、保存、運(yùn)輸
全血樣本:用EDTA抗凝管收集2ml全血,顛倒混勻抗凝管8-10次,-80℃保存,冷凍運(yùn)輸。
組織樣本:新鮮組織樣本離體后,用預(yù)冷PBS或生理鹽水快速將表面殘留的血跡沖洗干凈,切成黃豆大小,裝入2 0mIEP管或體積更大的旋蓋凍存管中,立即置于液氮中冷凍3-4 h以上,然后轉(zhuǎn)移至80℃或液氮中保存,冷凍運(yùn)輸。
細(xì)胞樣本:離心收集細(xì)胞(>1 xlOs個(gè)),液氮速凍,-80℃保存,冷凍運(yùn)輸。
客戶須知
客戶需提供:
新鮮足量的檢測(cè)樣本(血液、骨髓、組織、細(xì)胞、咽試紙等)或提取的質(zhì)量合格的足量DNA。
需檢測(cè)SNP位點(diǎn)的rs號(hào)、檢測(cè)基因中英文全稱、檢測(cè)基因位置(如5號(hào)外顯子區(qū))或參考文獻(xiàn)。
報(bào)告形式:
檢測(cè)方法:PCR+測(cè)序
檢測(cè)結(jié)果:序列比對(duì)圖