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血清標志物發現研究

血清標志物發現研究


Serum Biomarker Discovery
利用蛋白質組芯片進行系統篩查特定疾病的生物標志物對于疾病的診斷有著重要意義。博翀生物擁有一支專業的科研隊伍,為血清標志物的發現研究提供整體方案設計、芯片篩選和數據分析,提供潛在標志物列表及數據報告。
服務類別:芯片與生物信息學總訪問:744
最后更新:2016-3-11半年訪問:31
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產品簡介

 

血清標志物的發現對于早期、及時、準確的血清學診斷至關重要。利用蛋白質組芯片進行全局性、系統性地篩查對于特定疾病的生物標志物是一項有著巨大價值的研究工作。我們擁有一支專業的科研隊伍,為血清標志物的發現研究提供整體方案設計、芯片篩選和數據分析,最終提供潛在標志物列表及詳細的數據報告。

 
 

產品性能


基于蛋白質芯片的血清標志物的篩選是獲得生物標志物的第一步,后續仍需要嚴格的驗證。就這一部分而言,分為三個部分:
1. 樣品選擇
樣本的選擇和質量極其重要。考慮到疾病的復雜性和個體差異性,需要準確記錄每個樣本的各個參數,以獲得準確的和可靠的結論。
樣本選擇要求:
a. 有明確的臨床診斷結論;
b. 血清收集時最好未進行治療(除特別研究外)。

樣本信息登記表(根據不同疾病額外需更多參數):

樣本ID   來源及編號  
年齡   性別  
臨床診斷結論   其它特別備注  

備注:健康人隨機選擇但保證年齡分布和性別分布應與病人組一致。
取樣步驟和要求:
a. 需用促凝采血管,采血量為6-10ml,收集血清3-5ml;
b. 血樣需離心,離心轉速為3000rpm,4℃,5分鐘;
c. 所有血清標本用標準凍存管保存,1 ml/管,每例病人血清保存3-5管;所有標本于-20℃環境保存時間不大于7天, -86℃可長期保存。

2. 芯片篩選
按照本公司標準SOP執行,簡述為:
a. 芯片封閉——使用BSA封閉芯片上為結合蛋白的位點。
b. 血清樣品孵育——血清按照一定的比例稀釋,在存在封閉劑的條件下加入到芯片表面,該步驟使得血清中存在的抗體同其特異性識別的抗原結合;
c. 清洗——去除未結合的蛋白和抗體;
d. 熒光檢測——使用熒光標記的anti-Human-IgG或IgM或IgD的二抗針對性檢測結合的抗體,清洗后置于熒光掃描儀下顯示結果。

3. 數據分析
由本公司專業數據分析團隊完成,具體方法簡述為:
a. 依據芯片蛋白樣品標記文件(Gel file)提取所有血清樣本對應芯片上的所有蛋白點的熒光信號數據;
b. 使用基于背景的算法對芯片(樣品)間的數據進行歸一化處理;
基于數學檢驗統計分析,找出在開放性肺結核、非開放性肺結核特異性蛋白,并計算其與健康人和其它對照組的P值。
d. 畫出聚簇分析圖和box-plot圖,生成潛在血清標志物名單。


產品應用

 

 結核桿菌蛋白質組芯片及其分泌蛋白芯片,可用于發現結核病或結核感染相關的疾病標志物,如開放性肺結核、肺外結核、HIV共感染等。

 人蛋白質組芯片,可用于發現腫瘤、自身免疫疾病等的疾病標志物。

 以上獲得的潛在標志物均需要更多樣品和更嚴格的驗證。

 
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