產品性能
基于蛋白質芯片的血清標志物的篩選是獲得生物標志物的第一步,后續仍需要嚴格的驗證。就這一部分而言,分為三個部分:
1. 樣品選擇
樣本的選擇和質量極其重要。考慮到疾病的復雜性和個體差異性,需要準確記錄每個樣本的各個參數,以獲得準確的和可靠的結論。
樣本選擇要求:
a. 有明確的臨床診斷結論;
b. 血清收集時最好未進行治療(除特別研究外)。
樣本信息登記表(根據不同疾病額外需更多參數):
樣本ID |
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來源及編號 |
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年齡 |
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性別 |
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臨床診斷結論 |
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其它特別備注 |
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備注:健康人隨機選擇但保證年齡分布和性別分布應與病人組一致。
取樣步驟和要求:
a. 需用促凝采血管,采血量為6-10ml,收集血清3-5ml;
b. 血樣需離心,離心轉速為3000rpm,4℃,5分鐘;
c. 所有血清標本用標準凍存管保存,1 ml/管,每例病人血清保存3-5管;所有標本于-20℃環境保存時間不大于7天, -86℃可長期保存。
2. 芯片篩選
按照本公司標準SOP執行,簡述為:
a. 芯片封閉——使用BSA封閉芯片上為結合蛋白的位點。
b. 血清樣品孵育——血清按照一定的比例稀釋,在存在封閉劑的條件下加入到芯片表面,該步驟使得血清中存在的抗體同其特異性識別的抗原結合;
c. 清洗——去除未結合的蛋白和抗體;
d. 熒光檢測——使用熒光標記的anti-Human-IgG或IgM或IgD的二抗針對性檢測結合的抗體,清洗后置于熒光掃描儀下顯示結果。
3. 數據分析
由本公司專業數據分析團隊完成,具體方法簡述為:
a. 依據芯片蛋白樣品標記文件(Gel file)提取所有血清樣本對應芯片上的所有蛋白點的熒光信號數據;
b. 使用基于背景的算法對芯片(樣品)間的數據進行歸一化處理;
基于數學檢驗統計分析,找出在開放性肺結核、非開放性肺結核特異性蛋白,并計算其與健康人和其它對照組的P值。
d. 畫出聚簇分析圖和box-plot圖,生成潛在血清標志物名單。
產品應用
結核桿菌蛋白質組芯片及其分泌蛋白芯片,可用于發現結核病或結核感染相關的疾病標志物,如開放性肺結核、肺外結核、HIV共感染等。
人蛋白質組芯片,可用于發現腫瘤、自身免疫疾病等的疾病標志物。
以上獲得的潛在標志物均需要更多樣品和更嚴格的驗證。