質(zhì)譜法全序列分析的技術(shù)服務(wù)
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——即質(zhì)譜法全序列分析的技術(shù)服務(wù)
蛋白質(zhì)的氨基酸序列分析,包括N/C端氨基酸和全序列氨基酸序列分析。經(jīng)典的氨基酸序列分析方法主要是使用化學(xué)方法進(jìn)行解析(如Edman法),這里要介紹的是使用質(zhì)譜法對(duì)氨基酸全序列進(jìn)行分析。APT為客戶提供兩種質(zhì)譜方案,分別是MALDI-TOF/TOF法和LTQ-Velos法。其中MALDI-TOF/TOF方法擅長(zhǎng)對(duì)多肽類樣品進(jìn)行全序列分析(包括含有復(fù)雜修飾的多肽);LTQ-Velos方法較適合對(duì)蛋白質(zhì)類樣品的N/C端進(jìn)行氨基酸序列分析。不少多肽類的藥物分子中含有大量的非標(biāo)準(zhǔn)氨基酸、各種修飾和環(huán)形結(jié)構(gòu)等等,APT為客戶提供的質(zhì)譜法全序列分析是現(xiàn)有科技能力下的最有效的序列解析方法。
“當(dāng)遇到非標(biāo)準(zhǔn)氨基酸時(shí),經(jīng)典的化學(xué)方法(Edman)法就無(wú)能為力了。”
多肽類藥物的質(zhì)譜法結(jié)構(gòu)確認(rèn)
隨著生物科技的不斷進(jìn)步,多肽藥物在新藥研發(fā)中正占據(jù)越來(lái)越大的比重,而多肽分子結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性又要求對(duì)多肽藥物必須進(jìn)行全面表征,以滿足新藥報(bào)批、工藝改進(jìn)和專利保護(hù)的要求。目前多肽藥物的研發(fā)和表征還面臨很多挑戰(zhàn),尤其是在重組多肽的序列確證、不同批次間產(chǎn)品的比較和質(zhì)量控制等方面。
技術(shù)指標(biāo)
質(zhì)譜法全序列分析的供試品,大多數(shù)情況下是多肽類樣品。原因是對(duì)于全序列分析而言,分子量不宜太大(盡管現(xiàn)在也有一些Top-down的質(zhì)譜方法進(jìn)行全序列分析,但是目前APT并不提供這類服務(wù)工作)。多肽類樣品無(wú)論在MALDI-TOF/TOF還是LC-MS/MS中進(jìn)行序列分析,分子量的范圍一般情況下都在800-4000Da之間。分子量太小,由于碎片中的序列信息不足難以分析;分子量太大,由于質(zhì)譜儀器本身的碎裂能量限制,也不能得到良好的碎片信息對(duì)氨基酸序列進(jìn)行分析。
案例分析
下圖顯示的是一個(gè)多肽類藥物的全序列碎片圖譜,通過(guò)人工和算法比對(duì),可以從圖譜中得到多肽分子的序列信息。
質(zhì)譜法全序列分析案例圖譜
Q&A
1) 質(zhì)譜方法對(duì)多肽類藥物的復(fù)雜修飾、環(huán)形結(jié)構(gòu)進(jìn)行全序列解析工作。
使用質(zhì)譜方法對(duì)多肽藥物分子的全序列進(jìn)行分析的基本原理為:多肽分子的分子量一般在800-4000Da,在這個(gè)范圍內(nèi)質(zhì)譜儀能夠有效地分析多肽分子的分子量,并將其破碎后成為MS2。通過(guò)記錄供試品母離子及其碎片離子信息,再與其理論序列比對(duì),就可確定該序列中的氨基酸組成及排列方式。