ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）是使用高通量測序對 Tn5 轉座酶可接近的核染色質區域進行測序分析的一種研究技術；該技術由美國斯坦福大學的研究人員開發，2013 年首次發表在 Nature Methods（Buenrostro et al., 2013）。通過轉座酶對特定時空下開放的核染色質區域進行切割，獲得在該時空下基因組中所有活躍轉錄的調控序列。
ATAC-seq 技術可以進行樣本之間差異的染色質開放位點的比較，通常并不單獨使用。作為檢測表觀遺傳-染色質開放狀態現象的方式，與樣本基因表達譜緊密相連，從靶標基因的表觀狀態關聯到表達水平，具有強大的數據挖掘作用。此外，通過關聯基因組、外顯子，染色質免疫共沉淀（組蛋白修飾或轉錄因子結合）測序信息，形成： 表觀調控-基因組-基因表達的完整調控鏈。

技術優勢： 1.常量樣本至少需要5萬個細胞，微量樣本低至100個細胞（適用于稀有樣本） 2.技術重復性好，成功率高 3.實驗步驟簡單，周期短 4.獲得信息量大（全基因組開放染色質區域）

物種經驗： 1.多物種：多種動植物、模式生物和非模式生物 2.多器官組織類型：健康器官、疾病模型組織 3.多樣品類型：新鮮、凍存、固定

研究應用： 1.染色體開放性圖譜繪制(所有物種適用) 2.胚胎發育表觀遺傳修飾(胚胎學發育研究) 3.腫瘤發生表觀機制研究(腫瘤標記及病理研究) 4.疾病潛在標志物的預測(病理及生物標記) 5.腫瘤異質性或分型研究(腫瘤分型與微環境研究) 6.作物表觀修飾差異研究(包括水稻、玉米、小麥等)。