導讀
全球水禽病毒性疾病呈現出復雜多變的態勢,涉及眾多病原體,對水禽養殖業造成了巨大損害。近年來,全球水禽病毒性疾病顯著增加,包括鴨坦布蘇病毒(DTMUV)、鴨肝炎病毒(DHV)、番鴨呼腸孤病毒(MDRV)和番鴨細小病毒(MDPV)的爆發。這4種新興的水禽傳染病,由于臨床癥狀重疊,鑒別這些疾病頗具挑戰性。因此,開發一步多重實時熒光定量逆轉錄聚合酶鏈反應(qRT-PCR)檢測方法是非常必要的。
文獻解讀:
廣西大學Chenchen Wang等人近期于Microorganisms(影響因子IF:4.1)發表了一篇名為《One-Step Multiplex Real-Time Fluorescent Quantitative Reverse Transcription PCR for Simultaneous Detection of Four Waterfowl Viruses》的研究,文章開發出一種一步多重實時熒光定量逆轉錄PCR(qRT-PCR)檢測方法,能同時檢測鴨坦布蘇病毒(DTMUV)、鴨肝炎病毒(DHV)、番鴨呼腸孤病毒(MDRV)和番鴨細小病毒(MDPV),為水禽病毒病診斷提供了有效工具。
應用亮點:
• 使用Pangaea 6快速熒光定量PCR儀器系統(Aperbio,蘇州,中國)進行反應對單重和多重qRT-PCR反應體系進行優化,包括引物和探針濃度、退火溫度、擴增循環數等。
• 該方法具有高特異性、敏感性和重復性,避免與其他病毒如禽腺病毒(FADV)、傳染性法氏囊病病毒(IBDV)等多種病毒發生交叉反應。
• 臨床樣本檢測結果:對326份臨床樣本檢測發現,四種病毒均有一定陽性率,存在多種病毒共感染情況,且該方法與現有檢測標準檢測結果一致性高。
文章相關結果:
標準質粒pDTMUV、pDHV、pMDRV和pMDPV以最終濃度1:1:1:1混合,再進行十倍梯度稀釋至最終濃度2.68×107~2.68×100拷貝/µL(每反應5.36×107~5.36×100拷貝),并建立了多重qRT-PCR標準曲線。
圖例:多重qRT-PCR標準曲線
特異性、敏感性和重復性良好:該方法特異性高,對其他病毒無交叉反應;檢測限為2.68×101copies/μL ;批內和批間變異系數均小于2%。
圖例:特異性測試結果
圖例:敏感性測試結果