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ABI 3730XL測序平臺的原理及特點

瀏覽次數:13389 發布日期:2011-6-8  來源:上海美吉生物醫藥科技有限公司

Applied Biosystems 3730XL測序儀是高質量的長片段讀取序列分析的測序平臺,應用靈活而廣泛3730XL可同時分析96個樣品,該儀器采用4色熒光同時檢測,可不間斷24小時運行,自動灌膠,上樣,電泳分離,檢測及數據分析。儀器除了能夠完成新基因測序工作或比較測序工作外還可進行多種片段分析,包括微衛星 DNA 分析,比較基因型分析,單核苷酸多態性 (SNP) 研究等。

                                       

ABI 3730XL測序儀

測序峰圖

雙脫氧鏈終止法原理

    雙脫氧鏈終止法又稱為Sanger法,其原理是DNA模板在DNA聚合酶、引物、四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)存在下進行復制時,在四管反應體系中分別按一定的比例引入四種雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,ddNTP摻入鏈的末端時,該鏈就會停止延伸。如此每管反應體系中就產生了一系列長度不等的以ddNTP3端的DNA片段。反應終止后,分4個泳道進行凝膠電泳以分離長短不一的DNA片段,相鄰的片段長度相差一個堿基。經放射自顯影后,根據片段3’端的雙脫氧核苷,便可獲得合成片段的堿基排列順序。

Sanger法測序原理圖

ABI 3730XL測序儀技術原理

ABI 3730XL自動測序儀是基于毛細管電泳和熒光標記技術的DNA測序儀。基于Sanger法,3730XL測序儀擁有96道毛細管,并用熒光標記代替了同位素標記,從而大大提高了DNA測序的速度和準確性。4種雙脫氧核苷酸(ddNTP)的堿基分別用不同的熒光進行標記,在通過毛細管時不同長度的DNA片段上的4種熒光基團被激光激發,發出不同顏色的熒光,被CCD檢測系統識別,并直接翻譯成DNA序列。

儀器特點

1. 雙光束雙側激光激發,光柵分光裝置和后置超薄CCD檢測成像系統

2. 自動灌膠、上樣、電泳分離、檢測及數據分析,可連續運行24小時無需人工干預

3. 一次電泳測定96個樣品,一天可跑12次測序電泳,每天的測序產率是1152個樣品

4. 自動堿基識別、基因型分析與質量評分判定

5. 最新POP-7液體分離膠動態內鍍毛細管壁使讀序長度達1000bp以上,精確讀序達800bp

6. 良好的溫控裝置提供了更大的溫控范圍(18~70)電泳溫度可達70有助于去除二級結構的影響

7. 高靈敏度減少DNA和測序試劑的使用量

8. 更高的自動化減少勞力成本及人為失誤的成本。

技術應用

1. 菌液、質粒、PCR產物測序

2. Fosmid/Cosmid/BAC雙末端測序

3. 大片段鳥槍法測序

4. EST測序和分析

5. 步移測序

6. SNP發現和重測序

7. STR分型

 

 

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