在應對病毒性大流行疾病時,為了有效控制病毒傳播和減少感染人群,快速且可靠的診斷是至關重要的。那么目前檢測COVID-19的 "黃金標準 "依賴于一種成熟的技術,即反轉錄定量聚合酶鏈反應,也叫RT-qPCR。簡而言之,這一程序包括RNA提取、逆轉錄成互補DNA或cDNA,以及用熱循環儀對轉錄本(病毒基因組的特異性)進行實時定量。
為了早期檢測和診斷,實時熒光定量PCR儀必須能夠檢測非常少量的病毒RNA。研究表明,檢測限(LOD)或以>95%置信度檢測到的最低RNA濃度,表示每1μL可能只有1拷貝的病毒RNA。因此,我們準備用COVID-19 RNA來確定Azure Cielo™的LOD。
材料和方法
Azure Cielo™ 實時熒光定量PCR系統的LOD或分析靈敏度使用FDA批準的COVID-19 genesig® Real-Time PCR assay進行檢測,如使用說明書(IFU)所述。使用試劑盒提供的陽性對照模板(PCT)生成6點標準曲線,如下所示:
▲ 表1. PCT系列稀釋液
SARS-CoV-2全基因組RNA從歐洲病毒全球檔案館(EvaG)獲得,并按照IFU中的描述進行連續稀釋,每個稀釋液進行20次重復。
結果和討論
通過表1的PCT稀釋液得到標準曲線(圖1),將病毒RNA/μL的拷貝數與Cq值關聯起來。
▲ 圖1. 標準曲線
數據顯示,在12.5cp/μL、1.25cp/μL和0.625cp/μL時,Azure Cielo™ 實時熒光定量PCR系統均檢測到20/20(100%)的重復,Cq平均值分別是30.49(圖2,綠色)、33.66(圖2,黃色)和34.80(圖2,橙色)。在0.06cp/μL時,檢測到12/20(60%)的重復,Cq平均值37.12(圖2,紅色)。
▲ 圖2. 病毒拷貝數與Cq值的關系
結果表明,針對SARS-CoV-2 RNA的檢測,Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統的最低檢測限LOD為0.625cp/μL,表明Azure Cielo™ 實時熒光定量PCR系統可用于快速可靠地檢測COVID-19。
Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統
Azure Cielo™實時熒光定量PCR系統來自于美國Azure Biosystems公司,配備高品質溫度模塊,采用光纖和CMOS的檢測系統,高能LED的激發,提供高靈敏和可靠的數據。