什么是多重PCR?
多重PCR(multiplex Polymerase Chain Reaction,mPCR)也稱復合PCR,它是在同一PCR反應體系中加入一對以上引物,各對引物分別結合在模板相對應位置,最終擴增出一條以上目的DNA片段(圖1),其反應原理、反應試劑和操作過程與一般PCR相同。
▲ 圖1:多重PCR反應示意圖(圖源網絡,侵刪)
熒光定量PCR可以實現多重PCR嗎?
當然是可以的,熒光定量PCR除了常規的單基因定量外,也是可以實現多個基因的同時檢測。單基因檢測我們一般使用染料法,通過染料分子與雙鏈DNA的結合來進行PCR反應的實時監測,但是這種結合是非特異的,我們無法區分同一個PCR反應體系中的多個目的DNA片段,因此需要采用另一種方式來同時進行多基因的檢測,也就是探針法。
▲ 圖2:染料法和探針法的檢測原理(圖源網絡,侵刪)
探針法通過與模板特異性結合的探針解決了特異性的問題,同時不同的探針可以標記不同的熒光基團,通過對不同探針之間的識別,從而實現對多個基因的同時檢測和定量。但是這又帶來一個問題,就是在針對不同基因設計探針時該如何選擇熒光基團呢?
在選擇熒光基團時首先要考慮一個問題,您要使用的儀器所配置的熒光通道是怎樣的,這里就以Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統和Stilla naica® 6色微滴芯片式數字PCR系統為例來進行說明。
▲ 圖:多重檢測示意圖(圖源網絡,侵刪)
Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統共有6個熒光通道,最多可同時檢測6個基因。為什么能同時檢測這么多基因呢,這里就要科普一個小知識了,那就是熒光是怎么產生的。當激發光照射到熒光基團上時,熒光基團就會發出發射光,也就是我們需要的熒光信號,對于不同的熒光基團,其接收的激發光和發射的發射光波長都是不一樣的,因此需要根據機器的特性進行選擇。對于Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統,只要使用的熒光基團在6個通道的激發和發射波長的范圍內,都支持使用。其次,Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統的熒光檢測通道的設計之初,就是要覆蓋市面上大多數的熒光基團類型,所以基本不需要擔心探針適配性問題。
▲ 圖4:Azure Cielo™ 6實時熒光定量PCR系統的熒光檢測通道
naica® 6色微滴芯片式數字PCR系統熒光探針的選擇與Azure Cielo™ 6相似,對于naica® 6色微滴芯片式數字PCR系統而言,其同樣配置有6個熒光檢測通道,6個通道的波長范圍也基本覆蓋了市面上大部分的熒光基團,無需擔心適配性和選擇問題。
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法國Stilla Technologies公司naica®六通道微滴芯片數字PCR系統,源于Crystal微滴芯片式數字PCR技術,自動化微滴生成和擴增,每個樣本孔可實現6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進行質控,3小時內即可獲得至少6個靶標基因的絕對拷貝數濃度。