代謝組學是對生物體內所有代謝物進行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關系的研究方式 (見:最接近生物表型的組學——代謝組學)。作為代謝組學常用的檢測方法,質譜 (MS) 和核磁 (NMR) 可以檢測機體某一特定時刻代謝物在體內完成復雜代謝后的總量,而無法精確到代謝物所處的具體代謝通路。
目前,可通過在代謝組學分析中引入放射或穩定同位素標記物示蹤劑去推斷其代謝路徑。但放射性同位素對人體有一定危害,穩定同位素無放射性、物理性質穩定、對人體無害,因此更受科研人員的歡迎。
圖 1. 代謝組學 (穩定同位素標記) 流程圖[1]
說的再多,都不如結合案例分析來得簡單,讓我們跟著小 M 往下看吧。
圖 3. AD 潛在生物標志物研究方法[3]
L:常規衍生化后的代謝物 MS;H:用穩定同位素標記衍生化后的代謝物 MS
■ 穩定同位素標記物在癌癥代謝組學研究中的應用
穩定同位素分析代謝組學 (Stable Isotope Resolved Metabolomics,SIRM) 是一種利用先進的 NMR 和 MS 分析方法,分析穩定同位素富集的前體到產物的單個原子的的過程,根據穩定同位素原子的跟蹤,可以揭示一些新的代謝途徑及治療靶點,SIRM 在腫瘤代謝研究中發揮了重大作用。DeNicola GM 等人用 U-13C-glucose 通過對非小細胞肺癌 (NSCLC) 細胞株的代謝跟蹤,研究了 NSCLC 中 Serine/Glycine 代謝路徑,對 NSCLC 的診斷和治療發揮了重要作用。
圖 4. 用 SIRM 對 NSCLC 代謝路徑的研究[4]
跟著小 M 看了這么多穩定同位素標記物在在代謝領域的貢獻,您目前肯定對穩定同位素標記物有了更深刻的印象了吧?下面就讓小 M 帶您再瀏覽下 MCE 穩定同位素類產品吧,說不定您的下一篇文章里面就有它們的身影呢!
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非靶標 (穩定同位素示蹤) 代謝組學可以研究代謝流隨時間的動態變化規律,不限于特定的代謝通路;靶標 (穩定同位素示蹤) 代謝組學主要針對能量代謝相關的三條代謝通路 (糖酵解途徑 EMP,TCA 循環,戊糖磷酸途徑 PPP)。
參考文獻
1. Jang C, Chen L, Rabinowitz JD. Metabolomics and Isotope Tracing. Cell. 2018 May 3;173(4):822-8372. Liang L, Sun F, Wang H, Hu Z. Metabolomics, metabolic flux analysis and cancer pharmacology. Pharmacol Ther. 2021 Aug;224:107827.
3. Yuan BF, Zhu QF, Guo N, Zheng SJ, Wang YL, Wang J, Xu J, Liu SJ, He K, Hu T, Zheng YW, Xu FQ, Feng YQ. Comprehensive Profiling of Fecal Metabolome of Mice by Integrated Chemical Isotope Labeling-Mass Spectrometry Analysis. Anal Chem. 2018 Mar 6;90(5):3512-3520
4. DeNicola GM, Chen PH, Mullarky E, Sudderth JA, Hu Z, Wu D, Tang H, Xie Y, Asara JM, Huffman KE, Wistuba II, Minna JD, DeBerardinis RJ, Cantley LC. NRF2 regulates serine biosynthesis in non-small cell lung cancer. Nat Genet. 2015 Dec;47(12):1475-81.