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新冠研究前沿:在iPS中利用CRISPRi系統發現病毒感染新機制(NEPA21)

瀏覽次數:1675 發布日期:2022-3-8  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)是一種嚴重的急性呼吸道傳染性疾病,其由急性呼吸綜合征冠狀病毒SARS-CoV-2感染所致。自COVID-19新冠肺炎疫情爆發至今,已兩年有余。除了疫苗接種,目前醫學界還沒有針對治療新冠的特效藥問世。而關于其感染機制的研究,對于新冠藥物的研發至關重要。
 

據報導,SARS-CoV-2的感染需要許多受體和蛋白酶。在感染期間,SARS-CoV-2刺突(S)蛋白與細胞表面表達的血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合,并被跨膜蛋白酶絲氨酸2(TMPRSS2)等蛋白酶切割,導致S蛋白分裂為S1和S2結構域。SARS-CoV-2通過S2結構域融合和侵入細胞。因此,SARS-CoV-2感染被認為是依賴于宿主細胞中ACE2和TMPRSS2的表達。然而,除了ACE2和TMPRSS2之外的其他蛋白分子也在SARS-CoV-2感染中起著重要作用。
 

近期,有研究學者通過通過CRISPR/Cas9基因編輯系統表達ACE2的人類誘導多能干細胞(iPS)檢測了神經纖毛蛋白-1(NRP1)、堿性蛋白BSG、跨膜絲氨酸蛋白酶(TMPRSS)和組織蛋白酶(CTS)在SARS-CoV-2感染中的作用。該研究發現雙重敲降TMPRSS2和組織蛋白酶B(CTSB)可將病毒載量降低至0.036%±0.021%。CTPB抑制劑CA-074甲酯和TMPRSS2抑制劑Camostat的組合更將病毒載量降低至0.0078%±0.0057%。這些研究結果都在四種SARS-CoV-2的變異株(β.1.3、β.1.1.7、β.1.351和β.1.1.248)中得到證實。同時使用這兩種藥物都可將人類男性和女性iPS中的病毒載量降低到0.01%以下。這些發現表明,對于TMPRSS2和CTSB的靶向化合物表現出高效的抗病毒效果,這可以為COVID-19的治療藥物研發提供一種思路。
 

為了闡明除ACE2以外的受體和蛋白酶在SARS-CoV-2感染中的功能,該研究通過使用過表達ACE2的iPS(ACE2 iPS)和CRISPRi系統抑制了BSG、CTSB和TMPRSS2基因的表達水平,并設計了針對這些基因的sgRNA。用表達sgRNAs、mKate2和抗病毒基因的質粒電轉染iPS,如下圖所示。

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在比較通過dCas9蛋白表達抑制ACE2的iPS中目標基因的表達水平后,對細胞進行SARS-CoV-2感染,如下圖所示。
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結果發現CTSL、CTSB和TMPRSS2的抑制使得ACE2 iPS中的病毒RNA拷貝數分別降低至11.7%±3.77%、0.84%±0.062%和20.6%±10.4%。TMRPSS2的抑制始終減少了刺突(S)蛋白的ACE2 iPS的數量。這些結果表明,CTSB、CTSL和TMPRSS2參與了ACE2 iPS的SARS-CoV-2感染。
 

基于上述發現,該研究團隊接下來探究了CTSB、CTSL和TMPRSS2抑制劑是否能抑制ACE2 iPS中的SARS-CoV-2感染。用SARS-CoV-2感染表達ACE2的iPS后,細胞在CA-074甲酯(CA-074 Me,CTSB抑制劑)、Z-Phe-Tyr(tBu)-重氮乙基酮(CTSL抑制劑)、卡莫司他(TMPRSS2抑制劑)或納法莫司他(TMPRSS2抑制劑)的存在下培養,如下圖所示。

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結果發現在表達ACE2的WTB CRISPRi Gen1細胞中,經CA-074 Me處理后,病毒RNA的拷貝數減少至0.62%±0.25%。在表達ACE2的1383D6細胞中,通過Camostat和Nafamostat處理,病毒RNA拷貝數分別減少至0.48%±0.023%和0.23%±0.14%。在這四種化合物中,Nafamostat對ACE2 iPS具有細胞毒性。這些結果表明,CA-074 Me或Camostat治療可降低ACE2 iPS中SARS-CoV-2的感染效率。

 

最后,該研究團隊檢測了TMRPSS2和CTSB的雙重敲降機制對于ACE2 iPS的SARS-CoV-2感染的影響作用。結果發現,感染的CTSB和TMPRSS2雙基因敲降細胞中的病毒RNA拷貝數低于感染的單基因敲降細胞中的病毒RNA拷貝數,如下圖所示。

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CRISPR/Cas9基因編輯系統可以使用轉錄阻遏物結構域(KRAB)和短引導RNA(sgRNA)融合的降解蛋白Cas9(dCas9)選擇性地抑制靶基因的表達。CRISPRi和iPS的組合可以將靶基因的表達抑制到1%或更低。此外,在由iPS誘導的體細胞中,該表達也保持低水平。到目前為止,利用iPS衍生的體細胞進行的SARS-CoV-2研究已得到廣泛開展。
 

值得一提的是,為了進行CRISPRi實驗,該研究團隊使用來自NEPA GENE的NEPA21高效基因轉染系統,并最終獲得了成功理想的實驗結果。


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NEPA21高效基因轉染系統采用獨特設計的電轉程序,可應用細胞、離體組織或動物活體的轉染。配合獨有的電壓衰減(Voltage/Decay)設計,可在獲得高轉染效率的同時,提高細胞存活率。專門針對難轉染的原代免疫細胞、干細胞、神經細胞、活體動物、受精卵及宮內胚胎等轉染。目前已有眾多應用文獻發表在高水平學術期刊,是基因編輯、細胞免疫等前沿生物研究中的首選品牌!
 

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參考文獻

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