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噬菌體展示文庫構建全流程

瀏覽次數:1214 發布日期:2023-6-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

1.什么是scfv抗體文庫
噬菌體展示文庫是將外源蛋白或多肽與噬菌體外殼蛋白融合,展示在噬菌體表面并保持特定的空間構象,利用特異性親和作用以篩選特異性蛋白或多肽的一項新技術。
Single-chain Fv(scFv)片段由抗體的最小功能性抗原結合結構域 (~30 kDa) 組成,其中可變重鏈 (VH) 和可變輕鏈 (VL) 通過肽接頭連接在一起。抗體文庫是指將抗體的可變區(VH和VL)基因,尤其是CDR區域(互補決定區)采用不同的策略和方式,如氨基酸突變,移碼讀框等形成數目龐大的不同克隆,并從這些克隆中篩選出針對目的抗原的高親和力單鏈Fv抗體。
3.scfv抗體文庫優點
ScFv 片段保留了親本抗體的結合特異性,與全長 mAb 相比具有多項優勢。
(1)具有藥代動力學特性,例如更好的組織滲透和快速的血液清除,有利于放射治療和診斷應用。例如,與完整抗體相比,這些片段可以更快地滲透到腫瘤中;當 scFv 在放射治療應用中與放射性核素結合時,它們從血液中清除率增加最大限度地減少了健康組織的暴露。
(2)重組抗體缺少 Fc 區,導致免疫原性低,因此與全長 mAb 相比,它們在許多應用中成為更好的治療劑。
(3)scFv 可以在細菌和哺乳動物細胞中克隆和表達,從而可以輕松且經濟高效地大量生產。
 
4.scfv抗體文庫應用
scfv抗體在人類生命科學發展歷程中發揮著重要作用。例如作為工具研究蛋白質功能 ,癌癥治療,由于尺寸較小可以與量子點、納米粒子結合,可以進入體內定位目標,作為運載藥物/納米粒子的載體等。
 
 
5.scfv抗體文庫構建服務的全流程介紹
scfv抗體噬菌體文庫構建服務,流程包括:抗體cDNA制備,基因擴增,載體構建,電擊轉化,抗體鑒定,scfv文庫包裝。
6.1抗體cDNA制備
6.1.1總RNA提取
將外周血淋巴細胞從冰箱取出后分裝,加入氯仿,離心后取上清加入異丙醇,離心保留沉淀,加入75%乙醇后離心保留沉淀,干燥后加入DEPC水,孵育確保RNA溶解,將各管混合到一管中即為總RNA,取1μl總RNA進行電泳,取2μl用核酸濃度測量儀測濃度。
 
6.1.2反轉錄獲取cDNA
按照商業化試劑盒操作說明書進行cDNA制備,將上一步得到的RNA一分為二反轉錄成cDNA,反轉錄引物分別用Oligo dTprimer及random 6-mers。
 
6.2 基因擴增
首先,以cDNA為模板擴增VH和VL(Vκ/Vλ)鏈可變區,進行兩輪PCR擴增。PCR反應(每個50µl)包含2µlcDNA (40 ng/µl)、1µl正向引物 (10µM)、1µl反向引物 (10µM)、0.5µl Q5 DNA 聚合酶, 1µl dNTP 混合物 (10µM) 和34.5µl dd H2O.然后,回收 PCR 產物。最后,通過重疊 PCR 連接 VH 和 VL 接頭。
6.3載體構建
PCR擴增產物scFv通過酶切連接到噬菌體質粒pADL-10b中,從而構建含有擴增片段的噬菌體質粒庫。將連接產物使用DNA純化回收試劑盒按說明書回收,分別取2μl用核酸濃度測量儀檢測回收產物的濃度。
 
6.4電擊轉化
6.4.1將連接產物進行電擊轉化后構建含有目的抗體片段的大腸桿菌文庫。
取SS320大腸桿菌感受態細胞,加入回收后的連接產物,將混合后的感受態細胞和連接產物轉移到預冷好的電轉杯中,使用電轉儀預設的轉化程序電擊轉化,電轉后立即往電轉杯中加入950μlSOC培養基,至少進行20個電轉。將細胞復蘇后涂在含有氨芐抗性的瓊脂糖培養板上過夜生長。將上一步過夜生長后的培養板上的細胞用2xYT培養基和涂布棒沖洗刮下,加入20%的甘油測OD600nm值后保存在-80℃,即為細菌文庫。
6.4.2噬菌體文庫擴增
將上一步刮下的菌體混勻后轉移到100 mL預先加入四環素的2x YT培養液中,37℃,250rpm培養直至OD600nm達到0.5-0.55。
按照輔助噬菌體:細菌細胞數目為20:1的比例加入輔助噬菌體后繼續37℃培養30分鐘。加入終濃度為50µg/mL的Kana和終濃度為0.2mMI PTG,30℃過夜搖床培養。
6.4.3噬菌體文庫制備
將過夜培養的細菌4℃ 4000 rpm離心20分鐘,將上清轉移到新的離心管后加入1/4體積預冷的的20%PEG/2.5M NaCl,在冰上孵育30分鐘。4℃ 4000 rpm離心20分鐘去除上清后加入1 mL PBS緩沖液溶解沉淀。再次加入1/4 體積預冷的20%PEG/2.5M NaCl后冰上孵育10分鐘,4℃ 12000 xg離心10分鐘后去除上清并將沉淀溶解在1 mL PBS中得到噬菌體庫,長期-80℃保存,短期(1-2周)可于4℃放置保存。
 
6.5抗體鑒定
隨機挑選20-50個克隆,PCR鑒定陽性率,測序和分析抗體序列。
 
 
6.6 scfv文庫包裝
交付>1x1013噬菌體顆粒/ml。
 
自 1988 年推出以來,scFv 在臨床前和臨床應用以及研究實驗室中變得高度相關。抗體工程的進步使高度定制的 scFv 的產生成為可能,這些 scFv 具有改善藥代動力學的特性,使其更具臨床相關性。將這些重組抗體與不同粒子偶聯,擴大了它們在診斷、治療和體內成像應用中的潛力。
 
發布者:卡梅德生物科技(天津)有限公司
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