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根據研究對象的不同，可以分為：DNA pull down、RNA pull down、GST pull down。
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DNA pull-down是體外研究DNA與蛋白互作的有力工具。該技術將生物素標記的DNA片段結合在鏈霉親和素磁珠上，再與細胞核蛋白孵育，純化出與DNA片段互作的蛋白，洗滌洗脫得到的蛋白產物，做Western-blot檢測特定蛋白是否與靶DNA片段結合;做質譜鑒定即可篩選出與DNA片段可能互作的蛋白信息(如：轉錄因子、組蛋白等)。
RNA pull down是體外研究RNA與蛋白互作的重要技術。該技術是用生物素標記體外轉錄的靶RNA分子，再用鏈霉親和素純化出與靶RNA結合的蛋白復合體，洗脫得到RNA結合蛋白質。再通過western blot實驗檢測特定的RNA結合蛋白是否與靶RNA結合；或通過質譜儀檢測可以篩選出與靶RNA結合的蛋白。
GST pull-down技術是一種體外驗證或篩選互作蛋白的技術。該技術將"誘餌"蛋白與一種易于純化的配體標簽（如：GST標簽）進行融合表達，而帶標簽的誘餌蛋白能被特異結合該標簽的固相親和配基捕獲，形成"次級親和支持物"，用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。純化產物洗脫后，經Western blot驗證或LC-MS/MS，即鑒定與誘餌蛋白互作的蛋白。
GST pull-down。
RNA pull down是體外研究RNA與蛋白互作的重要技術。該技術是用生物素標記體外轉錄的靶RNA分子，再用鏈霉親和素純化出與靶RNA結合的蛋白復合體，洗脫得到RNA結合蛋白質。再通過western blot實驗檢測特定的RNA結合蛋白是否與靶RNA結合；或通過質譜儀檢測可以篩選出與靶RNA結合的蛋白。
GST pull-down技術是一種體外驗證或篩選互作蛋白的技術。該技術將"誘餌"蛋白與一種易于純化的配體標簽（如：GST標簽）進行融合表達，而帶標簽的誘餌蛋白能被特異結合該標簽的固相親和配基捕獲，形成"次級親和支持物"，用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。純化產物洗脫后，經Western blot驗證或LC-MS/MS，即鑒定與誘餌蛋白互作的蛋白。
GST pull-down。
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