氨基酸類物質(zhì)是蛋白質(zhì)的組成單位、重要的能量物質(zhì)來源和前體物質(zhì),也是生命活動最重要的功能物質(zhì),參與能量代謝、免疫調(diào)控、內(nèi)分泌調(diào)節(jié)、信號傳導(dǎo)等生物過程,與腫瘤、心血管疾病、代謝性疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病等研究密切相關(guān)。本方法利用基于LC-MS的靶向代謝組方法對氨基酸類的30多種代謝物進(jìn)行絕對定量分析。
實驗流程
應(yīng)用方向
▶ 動植物生理病理
▶ 食品科學(xué)、化工等領(lǐng)域
數(shù)據(jù)分析
分析類型 |
分析內(nèi)容 |
質(zhì)控 |
QC RSD |
差異分析 |
單變量統(tǒng)計分析t test |
箱線圖 |
功能分析 |
層次聚類分析 |
KEGG分析 |
高級生信分析 |
回歸分析 |
趨勢聚類分析 |
機(jī)器學(xué)習(xí)ROC |
技術(shù)優(yōu)勢
▶ 高特異性和準(zhǔn)確性:采用基于LC-MS的金標(biāo)準(zhǔn)MRM技術(shù),精確定性、絕對定量
▶ 先進(jìn)平臺:Sciex Q-Trap質(zhì)譜,動態(tài)線性范圍廣
▶ 嚴(yán)格質(zhì)控:內(nèi)標(biāo)+外標(biāo),標(biāo)準(zhǔn)品人工校對,標(biāo)曲R2>0.99
檢測指標(biāo)
編號 |
代謝物名稱 |
Metabolites |
1 |
Glutamate |
谷氨酸 |
2 |
Glycine |
甘氨酸 |
3 |
Lysine |
賴氨酸 |
4 |
Aspartate |
天冬氨酸 |
5 |
Arginine |
精氨酸 |
6 |
Serine |
絲氨酸 |
7 |
Methionine |
蛋氨酸 |
8 |
Phenylalanine |
苯丙氨酸 |
9 |
Tyrosine |
酪氨酸 |
10 |
Leucine |
亮氨酸 |
11 |
Isoleucine |
異亮氨酸 |
12 |
Histidine |
組氨酸 |
13 |
Proline |
脯氨酸 |
14 |
Valine |
纈氨酸 |
15 |
Threonine |
蘇氨酸 |
16 |
Alanine/Sarcosine |
丙氨酸/肌氨酸 |
17 |
Asparagine |
天冬酰胺 |
18 |
Creatine |
肌酸 |
19 |
Spermidine |
亞精胺 |
20 |
Citrulline |
瓜氨酸 |
21 |
Glutamine |
谷氨酰胺 |
22 |
Cysteine |
半胱氨酸 |
23 |
Creatinine |
肌酐 |
24 |
Tryptophan |
色氨酸 |
25 |
Putrescine |
腐胺 |
26 |
Hydroxyproline |
羥脯氨酸 |
27 |
Ornithine |
鳥氨酸 |
28 |
Taurine |
牛磺酸 |
29 |
Cystine |
胱氨酸 |
30 |
Choline |
膽堿 |
31 |
Aminoadipic Acid |
氨基己二酸 |
送樣建議
樣本類型 |
常規(guī)送樣量 |
最低送樣量 |
建議生物學(xué)重復(fù) |
血(血清、血漿) |
≥200 μL |
≥100 μL |
臨床樣本:每組≥ 30 例
動物來源:每組≥ 10 例
植物來源:每組≥ 3 例
細(xì)胞樣本:每組≥ 6 例 |
尿液 |
≥200 μL |
≥100 μL |
動物組織 |
≥100 mg |
≥60 mg |
細(xì)胞 |
10^7 |
10^7 |
細(xì)胞上清 |
≥1mL |
≥500 μL |
細(xì)菌或真菌 |
沉淀濕重≥200 mg |
沉淀濕重≥100 mg |
發(fā)酵液 |
≥500 μL |
≥200 μL |
卵泡液、腦脊液、淋巴液等 |
≥200 μL |
≥100 μL |
植物組織 |
≥400 mg |
≥200 mg |
植物種子 |
≥400 mg |
≥200 mg |
其他特殊樣本 |
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參考文獻(xiàn)
1.Proteomic and Metabolomic Analyses Provide Insights into the Mechanism on Arginine Metabolism Regulated by tRNA Modification Enzymes GidA and MnmE of Streptococcus suis. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2020.
氨基酸靶向檢測-豬鏈球菌-研究GidA-MnmE修飾通路在豬鏈球菌中的分子作用機(jī)制【客戶文章】
2.Cytosolic Malate Dehydrogenase 4 Modulates Cellular Energetics and Storage Reserve Accumulation in Maize Endosperm. Plant Biotechnology Journal. 2020.
氨基酸靶向檢測-玉米胚乳-協(xié)助研究玉米胚乳中儲存復(fù)合物積累的分子機(jī)制【客戶文章】
3.Increasing phosphate inhibits cadmium uptake in plants and promotes synthesis of amino acids in grains of rice. Environmental Pollution. 2020.
氨基酸靶向檢測-水稻種子-應(yīng)用磷酸鹽可抑制水稻中鎘的吸收和增加稻粒中游離氨基酸合成【客戶文章】
4.Alteration of S-adenosylhomocysteine levels affects lignin biosynthesis in switchgrass. Plant Biotechnol J. 2018.
氨基酸靶向檢測-柳枝稷-S-腺苷高半胱氨酸影響柳枝稷中木質(zhì)素合成【客戶文章】
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