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RNA抽提的原則、目的和方法介紹

瀏覽次數:1205 發布日期:2022-8-9  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

RNA是以DNA的一條鏈為模板,以堿基互補配對原則,轉錄形成的一條單鏈,主要功能是使遺傳信息能夠翻譯成蛋白行使生物學功能,是遺傳信息向表型轉化過程中的橋梁。當我們研究基因的表達和調控時,第一步需要做的就是從組織或細胞中分離和純化RNA。

一、RNA提取的原則:

1.保證RNA的完整性;

2.獲得高純度的RNA;

3.操作簡便,穩定性強。

二、抽提RNA的使用目的:

RNA用于不同的后續實驗,其質量要求不盡相同。cDNA文庫構建要求RNA完整而無酶反應抑制物殘留;Northern對RNA完整性要求較高,對酶反應抑制物殘留要求較低;RT-PCR對RNA完整性要求不太高,但對酶反應抑制物殘留要求嚴格。因此,明確實驗目的是進行后續實驗的首要條件。

三、Trizol法抽提

Trizol是一種總RNA抽提試劑,內含異硫氰酸胍等物質,能迅速裂解細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法進行提取組織或細胞中的RNA。

1).Trizol作用原理

在勻質化或溶解樣品中,Trizol試劑可保持RNA的完整性,同時能破壞細胞及溶解細胞成分。加入氯仿離心后,裂解液分層成水相和有機相。RNA存在于水相中。水相轉移后,RNA通過異丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可從中間相沉淀得到DNA,加入異丙醇沉淀可從有機相得到蛋白質。

2.)標準Trizol提取步驟

液氮研磨--加入Trizol裂解混勻--加入氯仿抽提--離心--加入異丙醇沉淀--離心--酒精洗滌--離心--無酶水重溶。

3).具體實驗步驟

(1)實驗準備

RNase free的槍頭、EP管、PBS、Trizol、氯仿、異丙醇、75%乙醇、RNase free水;

(2)樣本處理

對取下的新鮮組織(50mg)用PBS快速清洗表面附著物,放入離心管,加入1ml Trizol勻漿。室溫靜置5min,4℃,12000 g,離心5min,吸取上層液體至新的離心管中;

(3)氯仿萃取

按0.2 ml氯仿/1 ml Trizol的量加入預冷的氯仿,即200ul,上下振蕩15s,室溫孵育5min。4℃,12000 g,離心15 min。混合物分離為下層紅色的酚-氯仿相、中間相以及上層無色水相,RNA存在于水相。

(4)轉移水相

轉移水相時,槍尖隨著液面下移而下移,避免擾亂分層,慢慢吸取,避免吸到中間相和下層有機相,更不要貪心吸太多,吸大約400ul就好,轉移至新離心管中。

(5)異丙醇沉淀

加入等體積預冷的異丙醇,混勻,靜置10分鐘后,4℃,12000g離心10min,棄上清。異丙醇主要用于沉淀RNA。

(6)乙醇洗滌

加入1ml預冷的75%乙醇,輕輕將整塊沉淀吹起懸浮,此處千萬注意別把RNA沉淀吹散,因為RNA吹散后很難通過離心重新聚集在一起,最終導致實驗失敗。4℃,12000 g,離心5 min。

(7)RNA溶解

盡量吸除上清,室溫干燥3-5min,此處注意不要干燥過度否則會引起RNA難溶甚至降解,也不宜時間過短使酒精揮發不完全。加入30-50ul RNase free水(量視RNA提取量大小而定),充分溶解沉淀,保存于-80℃。

(8)RNA濃度檢測和電泳評估RNA濃度和質量。

當然現在也有許多抽提RNA的試劑盒可供大家選擇,操作相對更加簡單,省時省力。

不同抽提方法優缺點

最后,關于改善RNA提取質量的一些小建議

1.使用正確的細胞或組織儲存條件,在樣品用液氮速凍后,應該儲存在-80℃,樣品在RNA提取之前應避免反復凍融。

2.研磨過程要迅速,徹底勻漿樣品。

3.盡量使用無RNase的槍頭、試管和溶液,手套也應經常更換;實驗前移液器、工作臺、玻璃器皿,最好用RNaseZap擦拭。

4.建議分裝RNA溶液進行保存,避免反復凍融,導致RNA降解。

5.使用Rnase-free的雙蒸去離子水或其他緩沖液溶解RNA,否則容易導致RNA降解。

6.結合組織樣本本身的特點,選擇最優的抽提方案。

 

來源:上海博湖生物科技有限公司
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