SrfA是surfactin合成的功能基因，是一個長達26.2 kb大小的基因簇，因此，通過過表達該基因來強化surfactin的合成途徑在技術上存在較大難度。該功能基因受到啟動子PsrfA的調控，而啟動子的強弱可以在一定程度上決定菌株的生產能力，因此，啟動子替換被認為是提高原始菌株產脂肽的合理手段。

      啟動子改造促進產量提升的典型成功案例來自于對天然高產菌株的改造結果。Sun等通過同源重組的方法將B. subtilis fmbR中的啟動子PsrfA替換成一個來源于B. subtilis的強誘導型啟動子Pspac，得到了重組菌株fmbR-1；在IPTG (300μmol/L)誘導下重組菌株fmbR-1的產量是野生型出發菌株的10倍，產量達到3.86g/L；在無IPTG添加條件下，fmbR-1的產量也可以高達5倍左右。除了替換一些天然強啟動子外，還可以替換一些人工合成的啟動子。清華大學于慧敏課題組在surfactin的啟動子改造方面也獲得了顯著成果。Song等分析了surfactin高產野生菌株B. subtilis THY-7的轉錄組數據，發現該菌株控制surfactin合成的原始啟動子PsfrA是一個弱啟動子，同時也發現了菌株自身的一些強啟動子(PgroE、PsacB、PsacP)；令人驚訝的是用強啟動子PgroE替換原始啟動子PsfrA后，重組菌株不能合成surfactin；隨后人工構建了3個雜合型強啟動子Pg1、Pg2和Pg3用于改造B. subtilis THY-7菌株。

     雜合型啟動子Pg1融合了啟動子PgroE的–35到–10序列和PsacB的RAT誘導元件序列，重組菌株THY-7/Pg1的產量達到了1.44g/L。雜合型啟動子Pg2是在Pg1的基礎上，在PgroE的–35到–10序列中間融合了一段lacO操縱子序列，重組菌株THY-7/Pg2的產量為5.98g/L。雜合型啟動子Pg3是根據枯草芽胞桿菌的sigma因子70(σA)的–35到–10的保守序列以及點突變Pg2的2個堿基的基礎上設計而來的，最終重組菌株THY-7/Pg3在5L發酵罐上(具有泡沫回收裝置)發酵32h的產量達到了9.74g/L，表明改造后的菌株具有高產、高生產速率等優良性狀。該重組菌株的surfactin產量也是目前報道的最高產量。

     但是，在模式菌株或其他菌株中也存在啟動子改造的失敗案例。Coutte等用組成型啟動子PrepU替換了B. subtilis 168衍生菌株BBG111的PsrfA后，得到突變菌株BBG113的surfactin產量卻有所下降。隨后Wilenbacher等的研究發現，用一個強的組成型啟動子Pveg分別替換產surfactin能力弱的菌株3A3B和產surfactin能力強的DSM 10T的原始啟動子PsrfA，產生重組菌JWSurf2和JWSurf3；結果發現重組菌JWSurf2的surfactin產量高于原始菌3A3B，而JWSurf3的產量卻遠低于原始菌DSM 10T。

      由此我們可知，通過定向改造產surfatin菌株的啟動子PsrfA并不都會導致surfactin產量的提高，這可能與菌株自身產surfactin能力的強弱以及菌株特性有關。對野生型surfactin生產菌株進行啟動子改造前，有必要對菌株的轉錄組進行分析，有針對性地改造或構建適合該菌株的強啟動子或雜合啟動子，有助于提高成功率。同時，也要考慮到野生芽胞桿菌的遺傳操作系統存在很多不確定性，大大增加了分子改造的難度；選擇和構建合適的遺傳操作方法是成功的基礎。