RNA提取實驗操作步驟及注意事項
瀏覽次數:500 發布日期:2022-6-8
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操作步驟:
1、準備工作
A、 玻璃勻漿器、75℅乙醇預冷 ,離心機預冷至4℃ 打開超凈工作臺紫外燈15分鐘以上
B、 用酒精擦拭臺面 EP管標記
2、勻漿處理
1、取一定量的純化過的孢子懸浮液,12000rpm ,離心5min,棄上清
a 、或者用勻漿儀進行勻漿處理,懸浮液不經離心,直接加0.5ml Trizol reagent于冰上充分勻漿懸浮液樣品體積一般不要超過Trizol體積的10%.,然后再加入0.5ml Trizol 沖洗勻漿器,轉移至1.5ml EP管中
b、 直接在懸浮液中加入Trizol裂解細胞,加1ml Trizol.用取樣器吹打幾次.(離心取細胞,每5-10×106動物、植物和酵母細胞或每107細菌細胞加1ml Trizol。加Trizol前不要洗滌細胞,以免降解mRNA。一些酵母和細菌細胞可能需要勻漿儀處理)
2、1ml Trizol Reagent,震蕩混勻
3、將勻漿樣品在15-30℃放置5mim,使得核酸蛋白復合物完全分離。
4、可選步驟:4 ℃ 12 000rpm離心10min,取上清。
如果樣品中含有較多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物結節部分等,可離心去除。離心得到的沉淀中包括細胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。處理脂肪組織樣品時,上層是大量油脂,應除去。取澄清的勻漿溶液進行下一步操作。
5、每使用1ml Trizol加0.2ml氯仿,蓋好管蓋,在漩渦振蕩器上震蕩15s,室溫放置3min。如不能渦旋混勻,可手動顛倒混勻2min代替。
6、4 ℃ 12 000rpm,離心10-15min,樣品會分成三層:紅色的有機相,中間層和上層無色的水相,RNA主要在水相中,把水相(約600ul,約為所用Trizol試劑的60%)轉移到新管中。(如要分離蛋白質和DNA,可保留黃色的有機相)
7、在得到的水相溶液中加入等體積(500ul)的異丙醇,上下顛倒混勻,-20℃ 放置20-30min。
(植物或動物組織RNA提取中,容易沉淀出大量的蛋白等污染物,導致電泳檢測時看不到RNA。可以按以下步驟操作減輕污染:在上清中加入1/2體積的異丙醇,1/2體積的RNA助沉劑,然后進行以下操作。)
8、4 ℃ 12 000rpm離心10min,去上清。
(離心前RNA沉淀經常是看不見的,離心后在管側和管底形成膠狀沉淀。)
9、加入1ml 75%乙醇(DEPC水處理過的水配制)洗滌沉淀。加入后把管子敲一敲,盡量使RNA沉淀飄起來,每使用1ml Trizol至少加1ml乙醇。有時,為避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗滌之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能過于干燥,否則不易溶解。
10、4 ℃ 12 000rpm離心5min,棄上清;短暫快速離心,用移液器小心吸棄上清,注意不要吸棄沉淀。
11、室溫放置晾干(不要晾得過干,RNA完全干燥后會很難溶解,大約晾干2-3min左右即可)。加入適量DEPC水(根據實驗需要,可加30-100ul水)或0.5%SDS,用槍頭吸打幾次,充分溶解RNA。50度保溫1小時。如RNA用于酶切反應,勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅ 的去離子甲酰胺。溶解,-70℃保存。可以分裝保存,防止污染,
12、取1ul+1ul buffer 電泳檢測RNA完整性,稀釋一定倍數,分光光度計測定純度和濃度。
注意事項:
1. 從少量樣品中提取RNA(1-10mg組織或102-104細胞) :
加800ul Trizol,樣品裂解后加氯仿,分層,沉淀RNA前,加5-10ug RNase-free糖原,糖原會與RNA一同沉淀出來,糖原濃度不高于4mg/ml時不會影響反轉錄cDNA第一鏈的合成,也不影響PCR反應。
2. 勻漿后,加氯仿前,樣品可在-70 ℃放置一個月以上:
RNA沉淀可以保存在75%酒精中,2-8 ℃一個星期或-20 ℃一年以上。如果要長期保存,RNA可以溶解于100%去離子甲酰胺中,-70 ℃長期保存。