幾種PCR方法概述及其優點
瀏覽次數:482 發布日期:2023-1-10
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一、反向PCR
反向PCR是用反向的互補引物來擴增兩引物以外的未知序列的片段,而常規PCR擴增的是已知序列的兩引物之間DNA片段.實驗時選擇已知序列內部沒有切點的限制性內切酶對該段DNA進行酶切,然后用連接酶使帶有粘性末端的靶序列環化連接,再用一對反向的引物進行PCR,其擴增產物將含有兩引物外未知序列,從而對未知序進行分析研究。
二、不對稱PCR
不對稱PCR是用不等量的一對引物,PCR擴增后產生大量的單鏈DNA這對引物分別稱為非限制引物與限制性引物,其比例一般為50~100∶1.在PCR反應的最初10~15個循環中,其擴增產物主要是雙鏈DNA,但當限制性引物低濃度引物消耗完后,非限制性引物高濃度引物引導的PCR就會產生大量的單鏈DNA.不對稱PCR的關鍵是控制限制性引物的絕對量,需多次摸索優化兩條引物的比例.還有一種方法是先用等濃度的引物PCR擴增,制備雙鍵DNA,然后以此dsDNA為模板,再以其中的一條引物進行第二次PCR,制備ssDNA.不對稱PCR制備的ssDNA,主要用于核酸序列測定。
三、重組PCR
使兩個不相鄰的DNA片段重組在一起的PCR稱為重組PCR,1986年報道了由PCR擴增的兩個DNA片段通過重組合后再經延伸而制備出新的DNA分子.其基本原理為將突變堿基,插入或缺失片段,或一種物質的幾個基因片段均設計在引物中,先分段對模板擴增,除去多余的引物后,將產物混合,再用一對引物對其進行PCR擴增.其產物將是一重組合的DNA.重組PCR主要用于位點專一堿基置換,DNA片段的插入或缺失DNA片段的連接(如基因工程抗體)。
四、多重PCR
一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR,又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同。
五、免疫PCR
免疫試驗的主要步驟有三個:
①抗原抗體反應,
②與嵌合連接分子結合,
③PCR擴增嵌合連接分子中的DNA一般為質粒DNA該技術的關鍵環節是嵌合連接分子的制備.在免疫-PCR中,嵌合連接分子起著橋梁作用,它有兩個結合位點,一個與抗原抗體復合物中的抗體結合,一個與質粒DNA結合,其基本原理與ELISA和免疫酶染色相似,不同之處在于其中的標記物不是酶而是質粒DNA,在操作反應中形成抗原抗體-連接分子復合物,通過PCR擴增DNA來判斷是否存在特異性抗原。
免疫PCR優點為:
①特異性較強,因為它建立在抗原抗體特異性反應的基礎上。
②敏感度高,PCR具有驚人的擴增能力,免疫PCR比ELISA敏感度高105倍以上,可用于單個抗原的檢測。
③操作簡便,PCR擴增質粒DNA比擴增靶基因容易得多,一般實驗室均能進行。