關于RNA降解詳細介紹
瀏覽次數:303 發布日期:2023-11-29
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RNA抽取一般使用Trizol法抽提:
Trizol是一種總RNA抽提試劑,內含異硫氰酸胍等物質,能迅速裂解細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法進行提取組織或細胞中的RNA。
Trizol作用原理:
在勻質化或溶解樣品中,Trizol試劑可保持RNA的完整性,同時能破壞細胞及溶解細胞成分。加入lv仿離心后,裂解液分層成水相和有機相。RNA存在于水相中。
水相轉移后,RNA通過異丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可從中間相沉淀得到DNA,加入異丙醇沉淀可從有機相得到蛋白質。
接下來了解RNA提取中RNA降解原因:
一、RNA降解原因:
1 、 新鮮細胞:
裂解液的量不足,使得裂解不充分。
2 、 新鮮組織:
某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。
3 、冷凍樣品:
樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存放。如果未經液氮速冷直接轉移到-70℃冰箱存放,會造成RNA緩慢降解。樣品研磨后,在液氮剛剛揮發完時,將樣品迅速轉移到含裂解液的容器中,立即混勻勻漿。
4 、內源 RNA 酶的污染:
抑制劑失效或者用量不夠,實驗樣品過多或者勻漿溫度過高。
5 、 外源 RNA 酶的污染:
試劑、器械等實驗用品應該采用DEPC 水滅菌處理。
RNA降解是非常嚴重的問題,在RNA提取過程中,為防止降解我們需要遵守以下4點基本規則:
二、基本規則:
1. 把所有接觸RNA的塑料制品以及玻璃制品都高壓滅菌。
2. 用于RNA 緩沖液的所有水都要經DEPC處理。加DEPC到終濃度0.1%,再室溫放放置過夜,或者滅菌15min 。DEPC 不能用于Tris 緩沖液,因為DEPC將會降解成乙醇和二氧化碳。
3. 避免堿性緩沖液,因為RNA中的羥基對堿非常敏感。
4. 將RNA 緩沖液與其他緩沖液分開放置,避免用錯或被RNases污染。