BMC Genomics: Let-7b調控矮腳雞的骨骼肌生長和脂肪沉積
瀏覽次數:2443 發布日期:2012-11-22
來源:聯川生物
生長激素受體(Growth Hormone Receptor, GHR)基因的一個缺失突變將抑制矮腳雞的骨骼肌生長和脂肪沉積。華南農業大學李玉谷教授和張細權教授領銜的課題組從miRNA角度入手,分析了miRNA調控GHR表達進而影響骨骼肌生長和脂肪沉積的機制。這一研究成果于近期發表于BMC Genomics*。
課題組利用miRNA微流體芯片(聯川生物提供技術服務)和基因芯片篩選分析了同一發育階段和不同發育階段矮腳雞的差異表達miRNA和基因。在相同發育階段,相比于正常雞,矮腳雞骨骼肌中有4個miRNA存在差異表達(miR-1623,miR-181b,let-7b,和miR-128)。而在不同發育階段,則有更多差異表達的miRNA。相比于14天齡胚胎,7周齡矮腳雞中有11個miRNA表達上調,18個表達下調,而在7周齡正常雞中則有7個miRNA表達上調,9個表達下調。在骨骼肌中,相比于7周齡矮腳雞,14天齡胚胎中有22個基因表達上調,33個表達下調,而相比于7周齡正常雞,卻有65個基因表達上調和108個表達下調。進一步對34個差異表達miRNA根據重疊種子區域和靶標序列分為18個類別。只有let-7b作用的靶點位于GHR基因的3'非編碼區,并能抑制其表達。通過KEGG Pathway分析和qPCR實驗發現有三個主要的信號通路調節雞的骨骼肌生長和脂肪沉積。而這些通路都受let-7b調控的GHR影響。研究還發現抑制細胞因子信號3(Suppression Of the Cytokine Signaling 3 , SOCS3)基因參與了脂肪細胞因子信號通路。
*Lin SM, Li HM, Mu HP,et al. (2012) Let-7b regulates the expression of the growth hormone receptor gene in deletion-type dwarf chickens. BMC Genomics 13: 306.
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