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伯豪客戶《EMBO reports》上闡述circRNA在膀胱癌中的作用機制

瀏覽次數:2606 發布日期:2017-10-10  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
研究背景

膀胱癌(Bladder cancer)是一種常見的泌尿系統腫瘤,由于易轉移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的發病機制,有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA,是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發,深入闡述了一個circRNA在膀胱癌中的作用機制。

研究思路

 

研究結果

1. 膀胱癌特異性circRNA的篩選與鑒定

為篩選和膀胱癌特異性相關的circRNA,研究人員對3對配對癌組織和正常膀胱組織進行了circRNA特異性的高通量測序(伯豪生物參與),共鑒定到16,353個circRNA。其中,有88.35.%的circRNA來源于exons,有524個在癌組織中下調,47個上調。

接下來,研究人員在膀胱癌細胞系(T24T和UMUC3)中進行了RT-PCR驗證,發現circHIPK3穩定地在兩種細胞系中表達。進一步的分析和大樣本鑒定表明,circHIPK3在79.5%的膀胱癌組織中特異性降低,并與grade, invasion和淋巴結轉移相關。FISH實驗表明,circHIPK3主要定位于細胞質中。

2. circHIPK3抑制膀胱癌細胞的遷移和侵襲

為探究circHIPK3的生物學功能,研究人員在兩個細胞系中過表達circHIPK3,進行細胞表型檢測。結果顯示,細胞遷移和侵襲受到抑制。當siRNA敲降circHIPK3時,細胞遷移和侵襲增強。因此,circHIPK3在膀胱癌細胞中影響了細胞的遷移和侵襲能力。

3. circHIPK3在膀胱癌細胞中大量吸附miR-558

在第一篇circHIPK3的研究中,其就是通過miRNA sponge方式發揮功能。那么,在膀胱癌中,是否也是ceRNA方式呢?通過miRanda,PITA和RNAhybrid預測,發現有12個miRNA能與之結合。Pull down實驗表明,miR-558能在T24T和UMUC3中與circHIPK3結合。進一步的突變實驗也驗證了兩者的結合關系,FISH實驗也驗證了兩者在細胞質中的共定位。因此,circHIPK3能直接結合miR-558。

4. miR-558通過靶向HPSE影響膀胱癌細胞的遷移,侵襲和血管生成

先前的研究表明,miR-558在神經母細胞瘤中通過促進HPSE的轉錄,而影響遷移,侵襲和血管生成,而HPSE又在膀胱癌中高表達。因此,研究人員在膀胱癌組織和細胞系中對miR-558進行了驗證,確實發現表達上調。然后,通過過表達實驗,也發現膀胱癌細胞的遷移和侵襲增強。而抑制miR-558表達時,出現了相反的細胞表型。RT-PCR和Weston blot實驗表明,HPSE,VEGF,MMP-9表達在過表達時增強,抑制表達時減弱。因此,miR-558通過靶向HPSE影響膀胱癌細胞的遷移,侵襲和血管生成。

5. 過表達circHIPK3逆轉miR-558對細胞的影響

circHIPK3和miR-558的結合關系搞清楚了,兩者的生物學功能也是一致的,那么他們是不是通過這種關系在同一條路上起作用呢?結果顯示,過表達circHIPK3,HPSE,VEGF,MMP-9表達顯著降低,而當敲降circHIPK3時,都顯著上調。那么是否是通過結合miR-558發揮功能呢?把miR-558 mimic和過表達circHIPK3共轉染,可以發現HPSE,VEGF,MMP-9表達顯著降低了,遷移和侵襲也降低。因此,circHIPK3確實是通過吸附miR-558,調控了HPSE的轉錄來影響細胞的遷移,侵襲和血管生成。

6. 小鼠模型實驗驗證circHIPK3的生物學功能

體外細胞實驗驗證了功能,在體內是否work,這是一個問號。因此,研究人員將轉染circHIPK3的T24T細胞移植到裸鼠中。結果顯示,腫瘤的生長速率和質量比對照低。免疫組化實驗顯示,HPSE,VEGF,MMP-9表達受到抑制,CD31+,平均血管密度減少。另外,轉移模型實驗也明顯顯示,過表達circHIPK3的小鼠肺轉移能力減弱。因此,小鼠實驗也有效地驗證了circHIPK3對膀胱癌生長,血管生成和轉移的影響。

研究結論

本研究通過高通量篩選,體內體外的功能驗證實驗,報道了一個已經有研究的circRNA在膀胱癌中的生物學功能。當然,在膀胱癌中,circHIPK3是第一次報道,也是通過了吸附和之前報道的不同的miRNA發揮功能。因此,做circRNA研究,無論是有過研究,還是沒有研究過的,只要能把機制說清楚了,功能說明白了,都能在比較好的雜志上發表。

原文出處:Li Y, Zheng F, Xiao X, Xie F, Tao D, Huang C, Liu D, Wang M, Wang L, Zeng F, Jiang G. CircHIPK3 sponges miR-558 to suppress heparanase expression in bladder cancer cells. EMBO reports.2017.

發布者:上海伯豪生物技術有限公司
聯系電話:021-58955370
E-mail:market@shbio.com

標簽: circRNA 膀胱癌
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